Apport de l'analyse chromosomique sur différents microréseaux d'ADN dans l'identification de nouvelles mutations et la caractérisation de gènes candidats impliqués dans la déficience intellectuelle

Anomalies de structure du genome et Deficience Intellectuelle : Recherche des genes candidats de Deficience intellectuelle en utilisant l'analyse chromosomique sur microreseau d'ADN pangenomique 180K et l'analyse chromosomique sur microreseau d'ADN de haute resolution 1M ciblee des genes candidats de Deficience intellectuelle. L'analyse chromosomique sur microreseau d'ADN (ACM) de haute resolution est une innovation technologique puissante afin de detecter les aberrations chromosomiques concernant les variations du nombre de copies. En utilisant l'ACM 180K, l'ACM 1M et la PCR quantitative, nous avons identifie les 5 variations du nombre de copies (CNV) intrageniques pathogenes de novo impliquant les genes : RUNX1T1, KIAA1468, FABP7, ZEB2 (syndrome de Mowat-Wilson) et ANKRD11 (syndrome de KBG). Les 5 patients ayant une DI et une dysmorphie faciale. L'ACM 180K a revele une deletion d'une taille de 92 kb emportant le gene KIAA1468 candidat pour le syndrome de West chez un enfant de 3 ans presentant une DI severe et une encephalopathie epileptique infantile precoce. Le criblage des mutations du gene KIAA1468 a ete realise chez 35 patients atteints de syndrome de West. Un variant intronique c.2761-7 T>C et un variant faux-sens herite de la mere c.3547 G>A avec signification clinque inconnue ont ete identifies. En utilisant des approches par l'ACM 1M de haute resolution chez 45 patients atteints de DI idiopathique moderee a severe, un seul CNV causal a ete identifie, une deletion intragenique d'une taille de 28.37 kb du gene ZEB2. Notre etude confirme une frequence tres faible des deletions/duplications intrageniques avec la detection d'une seule aberration chromosomique (1/45). En conclusion, si la frequence des mutations ponctuelles est elevee, nous avons egalement souligne l'application de la technique de sequencage a haut debit avec un rendement diagnostique jusqu'a 45%-55% des cas de DI severe idiopathique chez lesquels aucun CNV n'a ete detecte sur ACM