Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil plasmid E.coli yang resisten terhadap ampisilin, streptomisin dan enrofloksasin. Delapan isolat E.coli yang telah diidentifikasi dan diuji sensitivitasnya terhadap ketiga antibiotik tersebut, selanjutnya diisolasi plasmidnyas. Isolat E. coli dipupuk pada kaldu laktosa diinkubasi dalam shaker incubator pada suhu 370 C semalam. Sel dipanen dengan sentrifugasi 12.000 rpm, selama 5 menit sebanyak dua kali. Isolasi plasmid dilakukan dengan metode lisis alkali menggunakan larutan lisis I, II, dan III. Presipitasi plasmid dilakukan dengan 3 M Na asetat dan ethanol absolut. Profil plasmid dibaca pada agarosa 1%, setelah dilakukan elektroforesis menggunakan marker plasmid. Hasil penelitian menunjukkan profil plasmid DNA E. coli tersebut teramati sebagai pita-pita DNA yang berpendar oleh pendedahan sinar ultraviolet. Plasmid yang terisolasi mempunyai ukuran yang sangat besar atau mega plasmid yaitu terletak pada 4268 bp, 4873 bp, 5148 bp dan terletak diantara 5148 bp dan 21.226 bp. Masing-masing isolat E. coli memiliki jumlah plasmid yang bervariasi antar 1 sampai 3 plasmid DNA. Kata kunci: Escherichia coli , resistensi, profil plasmid
Cancer is one of deathly diseases in the world. Many people conversely attempt to employ traditional medicine for primary health care, especially from Plants. Dianella nemorosa Lam. has their own local name in Papua, pra kepey and belongs to the Liliaceae family. It is one of the anticancer plants that is empirical efficacious usage. The aim of the research was to find out cytotoxic activity of methanol extract of D. nemorosa leaves against selected human cell line namely hormone-dependent breast carcinoma cell line (MCF-7), human breast carcinoma cell line (T-47D), colon carcinoma cell line (WiDR) and human-slymphoma cell line (Raji Cell). Leaves powder were extracted using methanol. Cytotoxic assay of the methanol extract was done using MTT [3-(4,5-dimetilthiazol-2-il)-2,5difeniltetrazolium bromida) assay method in vitro . The result indicated that methanol extract of D. nemorosa leaves possessed cytotoxic activity in all tested cancer cell line, with the IC 50 values of 1,794 µg/ml, 1,732 µg/ml, 1,719 µg/ml, and 1,049 µg/ml for MCF-7, T47D, WiDR and Raji cell line, respectively after incubation 24h. This species could be considered as potential sources of anticancer compounds. Further studies are necessary for chemical characterization of the active principles and more extensive biological evaluations.
Penelitian ini bertujuan mengetahui jumlah sel Purkinje cerebellum anak mencit umur 21 hari (pascasapih) setelah induksi Ochratoksin A selama periode organogenesis. Tiga puluh ekor mencit bunting dibagi secara acak menjadi 5 kelompok perlakuan dengan masing-masing 6 ulangan. Ochratoksin A dilarutkan dalam Sodium Bicarbonat, diberikan secara oral pada saat kebuntingan hari ke 7 sampai hari ke -14. Dosis perlakuan Ochratoksin A adalah 0,5 ; 1,0; 1,5 mg/kg bb dan sebagai kontrol tidak diberi perlakuan, serta kontrol placebo diberi perlakuan pelarut Sodium Bicarbonat. Induk mencit dipelihara sampai melahirkan. Pada umur ke 21 hari (pascasapih), anak mencit dikorbankan dan diambil bagian otaknya. Otak mencit selanjutnya dipreparasi dengan metode parafin dan pewarnaan menggunakan pewarnaan Haematoksilin Eosin. Data jumlah sel Purkinje dianalisis dengan Anava Satu Arah dan dilanjutkan dengan uji DMRT untuk mengetahui beda nyata antar perlakuan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Ochratoksin A yang diberikan pada mencit bunting selama periode organogenesis menyebabkan terhambatnya pertumbuhan jumlah sel Purkinje mencit perlakuan yang ditandai dengan semakin menurunnya jumlah sel Purkinje dibandingkan dengan kontrol dan kontrol placebo.
Aedes aegypti mosquito population could be controlled by using lethal ovitrap. The addition of hay infusions as a attractant greatly enhance Aedes aegypti eggs trapped, and papaya leaf juice may inhibit Aedes aegypti eggs evolve to larvae or a larvae to pupae stage. This study was conducted to find out the chemical compounds in hay infusion and papaya leaf juice. We used phytochemical test using UV-Vis Spectrophotometry, Thin Layer Chromatography, and High Performance Liquid Chromatoraphy (HPLC) method. The results showed that hay infusion contains 12,75 mg/L ammonium and <1,20 ppm (g/mL) lactic acid and papaya leaf juice contains 0,25% alkaloid, 0,14% flavonoid, 0,30% saponin, ?68 mg/L steroid and 11,34% tannin, but negative terpenoid. We concluded that hay infusion and papaya leaf juice contains chemical compounds that could be use as attractant and bioinsecticide to Aedes aegypti, respectively.
Wabah avian influenza (AI) di Indonesia telah terjadi sejak akhir tahun 2003 dan masih terjadi secara endemis sampai sekarang. Pada akhir tahun 2012 terjadi kasus kematian yang cukup tinggi pada itik yang disebabkan penyakit AI subtipe H5N1 yang diklasifikasikan ke dalam clade 2.3.2, sedangkan virus AI sebelumnya diklasifikasikan pada clade 2.1.1, 2.1.2 dan 2.1.3. Salah satu yang berperan dalam virulensi penyakit AI adalah motif asam amino C-terminal protein nonstruktural1 (NS1). Analisis sekuens virus influenza terutama protein nonstruktural 1 (NS1) yang berasal dari unggas mempunyai motif asam amino ESEV pada Cterminal sedang pada virus influenza manusia mempunyai motif RSKV pada C-terminal. Data sekuen NS1 untuk virus AI terbaru belum lengkap sehingga perlu disekuen untuk melengkapi data molekuler NS1 virus AI.Residu C-terminal protein NS1 virus avian influenza subtype H5N1 perlu dikaji karena mempengaruhi patogenisitas dan virulensi virus. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui motif asam amino pada C-terminal protein nonstruktural 1 (NS1) virus avian influenza yang menyerang itik pada tahun 2013. Sampel berasal dari kasus AI pada itik di Tulungagung dan Blitar pada tahun 2013. Isolasi virus menggunakan telur berembrio tertunas ayam. Identifikasi virus AI subtipe H5N1 menggunakan teknik reverse transcription polimerase chain reaction (RT-PCR) dengan primer H5 (Lee et al., 2001) dengan target amplifikasi 545 bp dan primer N1 (Payungporn et al., 2004) dengan target amplifikasi 131 bp. Amplifikasi gen NS1 menggunakan RT-PCR dengan 2 pasang primer (Bannet-Noah et al., 2007) yang didesain mengamplifikasi gen NS dan dilanjutkan proses sekuensing gen NS1. Sekuen yang diperoleh dianalisa dengan menggunakan software MEGA 5.05 yang meliputi multiple alignment, prediksi asam amino dan analisis pohon filogenetik. Hasil sekuen isolat diperoleh panjang nukleotida yang mengkode protein NS1 sepanjang 690 nt. Hasil analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa ke lima isolat uji tidak berada satu grup dengan dengan isolat asal Indonesia tahun 2003- 2008 dan berdekatan dengan klaster virus AI yang berasal dari Asia clade 2.3.2. Pada semua isolat tahun 2013 ditemukan delesi asam amino pada posisi 80-84, substitusi asam amino D92E, asam amino 149 semua isolat mempunyai asam amino alanine (A), asam amino ke 196 ditemukan adanya variasi substitusi berupa lysine (K) dan glutamic acid (E) dan asam amino pada gen NS1 mempunyai motif ESEV pada posisi PDZ ligand.
Penelitian ini bertujuan mengetahui potensi kit deteksi cepat Anigen® rapid test kit rabies Ag dalam mendeteksi virus rabies pada sampel otakanjing yang diperoleh dari lapangan yang meliputi batas deteksi, kecepatan reaksi, uji reaksi silang, uji sensitivitas, dan spesifisitas. Batas deteksi ditentukan dengan pengenceran secara serial kontrol positif virus rabies dan selanjutnya diuji dengan rapid test kit sesuai petunjuk produsen. Uji reaksi silang dilakukan dengan canine parvovirus, Escherichia coli, dan Salmonella sp. Uji sensitivitas dan spesifisitas dilakukan terhadap sampel otak yang telah dikonfirmasi positif rabies dengan uji fluorescent antibody technique. Konfirmasi uji rapid test tersebut dilakukan dengan reverse transcriptase polymerase chain reaction. Berdasarkan data yang diperoleh dalam penelitian ini dapat disimpulkan bahwa Anigen® rapid test kit rabies Ag mampu mendeteksi sampel yang mengandung virus rabies dengan titer 0,5 x log 106,5/0,03 ml, dengan rata-rata kecepatan reaksi 1,8 menit 29,35 detik (kurang dari 2 menit). Di samping itu Anigen® rapid test kit rabies menunjukkan tidak terdapat reaksi silang dengan canine parvovirus, Escherichia coli, dan Salmonella sp. serta mempunyai sensitivitas 92,30% dan spesifisitas 97,90%
Thermo stability is among of the vital enzyme characteristics for industrial application. Brevibacillus thermoruber LII was obtained as a potential isolate from the previous researchwhich screened the potential thermostable protease producing bacteria from Indonesian hotspring.The newly thermostable protease produced by thermophilic Brevibacillus thermoruber LII hadbeen purified and characterized. It was predicted that the pure enzyme obtained from Brevibacillusthermoruber LII was homo hexameric, having molecular weight of 36 kDa unit protein and itsnative was 215 kDa. In addition, it was also a neutral metalo serine protease according tobiochemical tests that it was totaly inhibited by PMSF (Phenylmethanesulfonyl fluoride) and EDTA(Ethylenediaminetetraacetic acid). It showed optimum activity at pH of 8 and active in acidic buffer(up to pH of 4). All of metal ion in the form of chloride salt (2.5 mM) which were tested on theenzyme enhanced the enzyme activity but Li2+. Ca2+ion increased the activity and the stability ofenzyme against thermal. The enzyme also showed the stability against solvent. The protease LIIhad optimum temperature at 60oC without CaCl 2and 80 – 85oC with addition of 2.5 mM CaCl 2. TheK Mand V maxvalues for the purified protease LII were 27.2 mg/ml or 0.362 – 0.272 M for substrateHammersteinCasein (MM 75–100 kDa) and 261.1 µg/minute/ml, respectively.
Aim: This study aimed to investigate the fibroblast cells proliferation in periradicular tissue using mineral trioxide aggregate (MTA) and selfadhesive resin cement as the adhesive material for vertical root fracture fragments following intentional replantation. Materials and methods:This study used 27 male New Zealand rabbits aged 8-12 weeks.The mandibular incisor of each rabbit was extracted, and to simulate vertical fracture, the incisor tooth was sectioned vertically from the cervical to the 2/3 apical.The samples were randomly divided into three groups of nine each.Group 1 (control group), no application of any material.Group 2, the fracture line was sealed using MTA.Group 3, with self-adhesive resin cement.All teeth in all groups were then inserted back (replanted) into the socket of the rabbits.Each group was further divided into three subgroups according to the duration of replantation, namely, group A: week 1, group B: week 2, and group C: week 3. Rabbits were sacrificed according to each duration of replantation for histological preparations.The number of fibroblast cells was evaluated by counting at the three viewpoints under the light-microscope (400× magnification) and Optilab camera; finally, the calculation results were averaged.Data were analyzed using a two-way ANOVA and post hoc LSD test, with a significance level of 95%.Results: Following MTA application in the third week produced the highest number of fibroblast cells (104 + 29.5) compared to other groups.Conversely, the lowest number of fibroblast cells occurred in the control group in the first week of observation (4.33 + 3.5). Conclusion:MTA produced the greatest fibroblast cell proliferation than self-adhesive resin cement, particularly in week 3 of vertical root fractures replantation.Clinical significance: As the adhesive material for vertical root fracture fragments, MTA generated greater fibroblast proliferation than selfadhesive resin cement.Therefore, it is recommended to use MTA to attach vertical root fracture fragments.
