Evolving strategy for an evolving virus: Development of real-time PCR assays for detecting all SARS-CoV-2 variants of concern
Kanti PabbarajuNathan ZelyasAnita WongMatthew A. CroxenTarah LynchEmily BussStephanie A. MurphySandy ShokoplesJamil N. KanjiGraham Tipples
10
Citation
35
Reference
10
Related Paper
Citation Trend
Keywords:
Duplex (building)
З моменту оголошення ВООЗ пандемії COVID-19 (11 березня 2020 р.) основна увага при вивченні проявів цієї нової коронавірусної хвороби приділяється пневмонії та гострому респіраторному дистрес-синдрому. Тим часом при COVID-19 розвиваються також інші ураження легень, які потребують негайного хірургічного втручання. Зокрема, йдеться про розвиток “спонтанного” пневмотораксу як безпосереднього наслідку ураження легеневої тканини вірусом SARS-CoV-2 COVID-19. Наводимо наш досвід спостереження в умовах загальнохірургічного відділення, яке надавало хірургічну допомогу хворим на COVID-19 на період оголошеного карантину в умовах великого промислового міста. У даному повідомленні представлені історії хвороби чотирьох пацієнтів із “спонтанним” пневмотораксом, що виявився прямим ускладненням нової коронавірусної хвороби COVID-19. Простежено можливі причини розвитку цього ускладнення саме при пневмоніях (пневмонітах), спричинених вірусом SARS-CoV-2 COVID-19 на противагу пневмоніям, спричиненим вірусами грипу та іншими, раніше вже відомими, коронавірусами.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Sars virus
Pandemic
Cite
Citations (0)
Вынужденное применение строгих критериев селекции, при определении показаний к обследованию на РНК SARS-CoV-2 в дебюте эпидемического подъема COVID-19, создает риски существенной недооценки числа инфицированных лиц в популяции по данным регистрируемой заболеваемости. Достаточно длительный период выделения SARS-CoV-2 с фекалиями пациентов, в том числе при субманифестном течении COVID-19, которое часто наблюдается у детей, позволяет использовать данный тип материала для выявления скрытой циркуляции SARS-CoV-2 на территориях и оценки объективности регистрируемых уровней заболеваемости. Инфекционные диареи являются наиболее распространенной группой нозологий, надзор за которыми обеспечивает доступность материала для проведения данного мониторинга. Наряду с этим, оценка распространенности SARS-CoV-2 в образцах фекалий позволяет корректнее оценить риски работы с таким материалом в лабораториях, проводящих скрининговую диагностику инфекционных диарей в период пандемии COVID-19.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Sars virus
Pandemic
Cite
Citations (0)
В конце 2019 – начале 2020 годов появились сообщения о вспышке инфекции, вызванной новым штаммом бета-коронавируса SARS-CoV-2, заболевание ВОЗ определила как coronavirus disease 2019 (COVID-19). В Санкт-Петербурге первый случай COVID-19 был диагностирован 2 марта 2020 г., период нарастания заболеваемости продолжался в течение 10 недель, максимальные показатели были зафиксированы в середине мая, в дальнейшем отмечалось статистически значимое снижение заболеваемости. Целью проведенного сероэпидемиологического исследования было определение уровня и структуры популяционного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 среди населения Санкт-Петербурга в период интенсивного распространения COVID-19. Отбор волонтеров для исследования проводили методом анкетирования и рандомизации путем случайной выборки. Критерием исключения была активная инфекция COVID-19 в момент анкетирования. На наличие специфических антител к SARS-CoV-2 обследовано 2713 человек. Возраст обследованных добровольцев варьировал от 1 года до 70 лет и старше. Результаты исследования показали, что в Санкт-Петербурге в активную фазу заболеваемости COVID-19 наблюдалась умеренная серопревалентность к SARS-CoV-2, составившая 26%, на фоне высокой частоты (84,5%) бессимптомной инфекции у серопозитивных лиц, не имевших в анамнезе перенесенного заболевания COVID-19, положительного результата ПЦР и симптомов ОРВИ в день обследования. Максимальные показатели коллективного иммунитета установлены у детей 1-6 лет (31,1%), детей 7-13 лет (37,7%) и лиц старше 70 лет (30,4%), различия с уровнем серопревалентности в возрастных группах 18-49 лет статистически значимы. В социально-профессиональной структуре населения наибольший уровень серопревалентности выявлен среди безработных (29,7%), работников здравоохранения (27,1%), образования (26,4%) и бизнеса (25%). У реконвалесцентов COVID-19 антитела вырабатываются в 75% случаев. У лиц с позитивным результатом ПЦР-анализа, проведенного ранее, антитела выявляются в 70% случаев. Результаты исследования о состоянии коллективного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 необходимы для разработки прогноза развития эпидемиологической ситуации, а также планирования мероприятий по специфической и неспецифической профилактике COVID-19.
2019-20 coronavirus outbreak
Coronavirus
Betacoronavirus
Pandemic
Cite
Citations (12)
В декабре 2019 г. появилась информация о новом заболевании, этиологическим фактором которого оказался β-коронавирус SARS-CoV-2. В Иркутской области первый больной COVID-19 выявлен 21 марта 2020 года. Это был завозной случай из Объединенных Арабских Эмиратов (ОАЭ). Период нарастания интенсивности эпидемического процесса продолжался 10 недель, после чего было зафиксировано постепенное снижение. Определение серопревалентности к COVID-19 было организовано в период с 23.06.2020 по 19.07.2020 г практически на максимальном уровне заболеваемости. Работа проводилась в рамках проекта Роспотребнадзора по оценке популяционного иммунитета к SARS-CoV-2 у населения Российской Федерации с учетом протокола, рекомендованного ВОЗ. Содержание антител к SARS-CoV-2 определяли методом иммуноферментного анализа (ИФА) с использованием набора реагентов для анализа сыворотки или плазмы крови человека на наличие специфических иммуноглобулинов класса G к нуклеокапсиду вируса SARS-CoV-2 производства ФБУН ГНЦПМиБ Роспотребнадзора (г. Оболенск) в соответствии с инструкцией по применению.
Результаты исследования показали, что коллективный иммунитет совокупного населения Иркутской области составил 5,8%. Его максимальный уровень установлен у детей 14-17 лет (13,8 %) и 1-6 лет (11,8 %). Показано, что при наличии контактов с больными COVID-19 риск инфицирования возрастает в 3,1 раза. После перенесенной COVID-19 антитела вырабатываются в 56,5 % случаев. Доля бессимптомных форм среди серопозитивных жителей Иркутской области составила 81,2 %.
Результаты оценки популяционного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 у населения Иркутской области свидетельствуют о том, что в период эпидемического подъема заболеваемости инфекцией COVID-19 сформировался невысокий уровень серопревалентности. После перенесенного заболевания у 43 % лиц, антитела не выявлены. Значительная доля бессимптомных форм инфекции характеризует высокую интенсивность скрыто развивающегося эпидемического процесса. Полученные результаты необходимо учитывать при организации профилактических мероприятий, включая вакцинацию, и прогнозировании заболеваемости.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Sars virus
Pandemic
Coronavirus
Cite
Citations (2)
Актуальность. 2020 год в истории человечества останется годом испытаний для населения более чем 180 стран мира, их правительств, экономик и систем здравоохранения в связи с пандемией острой респираторной болезни COVID-19, вызванной коронавирусом SARS-CoV-2. На конец мая в мире заболели коронавирусной инфекцией COVID-19 6 159 953 человек, 371 006 умерли, 2 738 179 выздоровели. Разработка вакцины против трех известных типов коронавируса может занять от одного до полутора лет и потребует дополнительно $2 млрд, считают во Всемирном банке. Цель исследования. Определить риски медицинской деятельности для учреждений первичной медицинской помощи в условиях эпидемии острой респираторной болезни COVID-19, вызванной коронавирусом SARS-CoV-2, и подходы к управлению ими. Материалы и методы. В качестве материалов исследования использованы научные источники (1 ед.), международные документы (7 ед.), законодательные и нормативно-правовые акты (10 ед.). Использованы методы системного подхода, системного и контент-анализа, концептуального моделирования. Результаты. Установлено, что в учреждениях первичной медицинской помощи Украины в период эпидемии острой респираторной болезни COVID-19, вызванной коронавирусом SARS-CoV-2, реализовались управленческо-организационные, нормативно-правовые, финансово-хозяйственные, операционно-технологические, кадровые риски за счет введения карантина на государственном уровне, утверждения нормативно-правовых документов по организации и оказанию медицинской помощи пациентам с COVID-19, в которые несколько раз вносились изменения за короткий период времени, начала второго этапа медицинской реформы с 01.04.2020 в учреждениях здравоохранения вторичной медицинской помощи. Предложено несколько направлений совершенствования подходов к управлению рисками в существующей системе риск-менеджмента учреждений первичной медицинской помощи: усиление руководства учреждением путем внедрения дополнительной специализированной функциональной структуры при руководителе – штаба управления учреждением в условиях эпидемии; разработка и реализация эффективной стратегии эпидемического мониторинга, профилактики и инфекционного контроля; обновления контента информации о рисках в целях обмена между всеми заинтересованными сторонами; пересмотр кадровой политики и кадрового обеспечения учреждения. Выводы. Существует необходимость оживления системы риск-менеджмента в учреждениях первичной медицинской помощи в связи со значительным усложнением эпидемической ситуации, которое может продолжаться длительный период времени. Необходимо пересмотреть подходы к управлению рисками в направлениях совершенствования управления учреждением, персоналом, эпидемической безопасностью, информационным обеспечением.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Sars virus
Pandemic
Cite
Citations (1)
Количество пациентов с сахарным диабетом неуклонно растет с каждым годом. В период пандемии COVID-19 люди с диабетов подвергаются большей опасности поскольку возникают сложности с составлением лечения от коронавирусной инфекции и СД.(1) Были выявленные некоторые комбинации препаратов, которые при совместном использовании теряют свои положительные свойства. При фармакотерапии сахарного диабета с коронавирусной инфекцией стоит учитывать совместимость лекарственных препаратов.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Sars virus
Coronavirus Infections
Coronavirus
Cite
Citations (0)
Эффективность Апротинина в качестве профилактического лечения COVID-19 изучалась на экспериментальной модели SARS-CoV-2 у хомяков и у медицинского персонала, работающего с пациентами COVID-19 в стационаре. Показана высокая эффективность Апротинина в пред- и постконтактной профилактике SARS-CoV-2.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Sars virus
Pandemic
Coronavirus
Coronavirus Infections
Cite
Citations (0)
Актуальность: Пандемия новой коронавирусной инфекции – COVID-19 (SARS-CoV-2) – остается глобальной проблемой здравоохранения. Несмотря на беспрецедентные усилия мирового сообщества, число случаев болезни превысило четверть миллиарда, свыше 5 миллионов человек скончались от этой болезни к концу 2021 года. Постоянное появление новых штаммов вируса требует тщательного изучения особенностей инфекционного процесса и возможных отличий течения болезни на фоне изучения патогенеза, диагностики, лечения и профилактики коронавирусной инфекции. Особенно тщательно следует изучать влияние инфекции на течение беременности, родов, послеродового периода. В контексте вышеизложенного, а также принимая во внимание отсутствие данных о возможном скором прекращении пандемии, исследование влияния COVID-19 (SARS-CoV-2) на здоровье беременной женщины является безусловно актуальным на сегодняшний день. Цель исследования – анализ современных данных о влиянии COVID-19 (SARS-CoV-2) на течение беременности, родов, послеродового периода, а также исследований, посвященных изучению состояния так называемых «транзиторных органов, связанных с беременностью», в первую очередь в плаценте, для лучшего понимания ситуации и дальнейшего прогнозирования направлений и перспектив будущих исследований очерченных вопросов. Методы: Для обзора был проведен поиск научной литературы за последние 2 года в PubMed по следующим ключевым словам:«COVID-19 (SARS-CoV-2)», «беременность и роды при COVID-19 (SARS-CoV-2)», «плацента при COVID-19 (SARS-CoV-2)». Результаты: В статье представлены современные данные о влиянии COVID-19 (SARS-CoV-2) на течение беременности и родов, а также исследование плаценты у женщин с COVID-19. Рассмотрены мировые данные об особенностях течения беременности на фоне заболевания и в зависимости от триместра беременности, а также «рабочие теории» патогенеза акушерских осложнений инфекции во время беременности. Проведен обзор данных по реакции со стороны «внеплодовых транзиторных тканей и органов при беременности (плацента)». Заключение: Необходима разработка единой национальной терминологии и классификации болезни COVID-19 и осложнений, связанных с ней, у беременных и новорожденных. Крайне необходимы дальнейшие исследования влияния COVID-19 на беременность. Отдельным направлением исследований должно стать изучение состояния здоровья, течение беременности и перинатальные последствия у вакцинированных женщин.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Sars virus
Coronavirus
Pandemic
Cite
Citations (3)
В декабре 2019 появилась информация о новом заболевании, этиологическим фактором которого оказался β-коронавирус SARS-CoV-2. В Ленинградской области первый случай COVID-19 выявлен 13 марта 2020 года. Период нарастания интенсивности эпидемического процесса продолжался 8 недель. Через один месяц после достижения максимального уровня заболеваемости было организовано исследование по определению серопревалентности к COVID-19 среди населения Ленинградской области. Работа проводилась в рамках проекта Роспотребнадзора по оценке популяционного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 у населения Российской Федерации с учетом протокола, рекомендованного ВОЗ. Содержание антител к SARS-CoV-2 определяли методом ИФА с использованием набора реагентов для анализа сыворотки или плазмы крови человека на наличие специфических иммуноглобулинов класса G к нуклеокапсиду вируса SARS-CoV-2 производства ФБУН ГНЦПМиБ Роспотребнадзора (г.Оболенск) в соответствии с инструкцией по применению. Результаты исследования показали, что коллективный иммунитет совокупного населения Ленинградской области составил 20,7%. Максимальный уровень коллективного иммунитета установлен у детей 1-6 лет (42,3%) и обследованных старше 70 лет (29,0%). Наибольший уровень серопозитивности, кроме детей и лиц старшего возраста, выявлен у безработных (25,1%). Наименьший уровень серопревалентности установлен в подгруппе госслужащих (12,8%) и подгруппе военных (16,7%). Показано, что при наличии контактов с больными COVID-19 риск инфицирования возрастает в 1,5 раза. После инфекции COVID-19 антитела вырабатываются в 82,1% случаев. У лиц с позитивным результатом ПЦР-анализа, полученным ранее, антитела выявляются в 82,8% случаев. Доля бессимптомных форм среди серопозитивных жителей Ленинградской области составила 86,9%. Результаты оценки популяционного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 у населения Ленинградской области свидетельствуют о том, что в период эпидемического подъема заболеваемости инфекцией COVID-19 сформировался средний уровень серопревалентности. После перенесенного заболевания у 18% лиц, антитела не выявляются. Значительная доля бессимптомных форм инфекции характеризует высокую интенсивность скрыто развивающегося эпидемического процесса. Полученные результаты необходимо учитывать при организации профилактических мероприятий, включая вакцинацию, и прогнозировании заболеваемости.
2019-20 coronavirus outbreak
Sars virus
Betacoronavirus
Coronavirus
Cite
Citations (7)
У доповіді зазначено, що в установах НАН України, зокрема в Інституті біохімії ім. О.В. Палладіна НАН України, Інституті біології клітини НАН України, Інституті молекулярної біології і генетики HAH України, Інституті мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України, активно ведуться роботи з розроблення прототипів вітчизняних РНК- та субодиничних вакцин проти коронавірусу SARS-CoV-2, який викликає небезпечне вірусне захворювання COVID-19.
2019-20 coronavirus outbreak
Betacoronavirus
Pandemic
Coronavirus Infections
Sars virus
Cite
Citations (1)