Epidemiological and Microbiological Characteristics of an Outbreak Caused by OXA-48-Producing Enterobacteriaceae in a Neonatal Intensive Care Unit in Jerusalem, Israel
Amos AdlerEster SolterSamira MasarwaTamar Miller-RollBassam Abu‐LibdehHatem KhammashKhalil NajemSusan DekadekChen Stein‐ZamirN NubaniAmin KunbarMarc V. AssousYehuda CarmeliMitchell J. Schwaber
39
Citation
25
Reference
10
Related Paper
Citation Trend
Abstract:
This study describes the course of an OXA-48-producing Enterobacteriaceae (OPE) outbreak that started in March 2012 in a neonatal intensive care unit (NICU) in Jerusalem, Israel. During the peak of the outbreak (January to August 2012), there were 49 patients who had proven or suspected acquisition of OPE in the NICU, including 16 with invasive infections, out of a total of 156 patients who were hospitalized during that period. Three children hospitalized in the pediatric ICU were identified as carriers of OPE. Three patients with a previous stay in the affected NICU were identified as OPE carriers upon admission to another hospital. The Ministry of Health was notified and then intervened in July 2012. Intervention included cohorting colonized patients, conducting frequent rectal-culture surveillance, and improving the implementation of infection control practices. As a result, the incidence of OPE acquisition declined to 5 cases in the first 4 months, followed by no new cases in the next 3 months. Thirty-one patient-unique isolates were available for analysis: 29 Klebsiella pneumoniae isolates, all belonging to a single clone (sequence type 39 [ST39]), and 2 isolates from Enterobacter cloacae. All isolates possessed the blaOXA-48 and blaCTX-M-14 genes, which are located on the same plasmid. This plasmid, similar to the global blaOXA-48-harboring vector, has now acquired blaCTX-M-14, leading to resistance to all β-lactam agents.Keywords:
Enterobacter cloacae
Christian ministry
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Citrobacter freundii
Citrobacter
Klebsiella
Cite
Citations (0)
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Enterobacteriaceae Infections
Serratia
Citrobacter
Cite
Citations (33)
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Proteus vulgaris
Citrobacter
Tazobactam
Cite
Citations (0)
Background: A total of 775 consecutive non-duplicate isolates of Enterobacteriaceae (534 E. cloacae, 137 S. marcescens and 104 C. freundii) were collected from 2005 to 2014 at 34 hospitals in Anhui Province, China. Material and Methods:The detection of plasmid-mediated AmpC β-lactamases (pAmpCs) was based on the inhibitor screening method.Then, the association with other β-lactamases and mobile genetic elements, like class 1 integron, ISCR1 and ISEcp1, were analyzed by molecular biology method.Results: Among the total of 775 isolates, the prevalence of pAmpC was discovered to be 8.1% (63/775) overall.In this study, the presence of pAmpCs was significantly linked to other β-lactamases and mobile genetic elements, among which bla CTX-M and class 1 integron were the most prevalent genotype. Conclusion:Therefore, various combinations of β-lactamases and mobile genetic elements were detected in the study.Plasmids were demonstrated to be the main vehicles for the dissemination of pAmpC genes.
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Citrobacter
Enterobacteriaceae Infections
Serratia
Cite
Citations (0)
Infections caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) are alarming in the clinical setting, as CRE isolates often exhibit resistance to most clinically-available antibiotics. Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) is the most common carbapenemase carried by CRE in North America and Europe, frequently detected in isolates of K. pneumoniae, Escherichia coli, and Enterobacter cloacae. Notably, KPC-expressing strains often arise from clonal lineages, with sequence type 258 (ST258) representing the dominant lineage in K. pneumoniae, ST131 in E. coli, and ST78 and ST171 in E. cloacae. Prior studies have demonstrated that carbapenem-resistant K. pneumoniae differs from carbapenem-susceptible K. pneumoniae at both the transcriptomic and soluble metabolomic levels. In the present study, we sought to determine whether carbapenem-resistant and carbapenem-susceptible isolates of K. pneumoniae, E. coli, and E. cloacae produce distinct volatile metabolic profiles. We were able to identify a volatile metabolic fingerprint that could discriminate between CRE and non-CRE with an area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) as high as 0.912. Species-specific AUROCs were as high as 0.988 for K. pneumoniae and 1.000 for E. cloacae. Paradoxically, curing of KPC-expressing plasmids from a subset of K. pneumoniae isolates further accentuated the metabolic differences observed between ST258 and non-ST258.
Enterobacter cloacae
Carbapenem-resistant enterobacteriaceae
Carbapenem
Cite
Citations (20)
Phenotypic Detection of Beta-lactamases among Proteus mirabilis, Enterobacter cloacae, and Citrobacter freundii Isolates from Urinary Samples in Gorgan, Northeast Iran
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Citrobacter
Proteus vulgaris
Cite
Citations (2)
Μελετήθηκε η μοριακή επιδημιολογία των Εντεροβακτηριακών στελεχών που παράγουν μεταλλο-β-λακταμάσες (MBLs) της ομάδας των VIM που απομονώθηκαν στην αρχή της επιδημίας στην Μονάδα Εντατικής Θεραπείας του Πανεπιστημιακού Γενικού Νοσοκομείου «ΑΤΤΙΚΟΝ». Όλοι οι Gram-αρνητικοί μικροοργανισμοί που απομονώθηκαν από τον Μάρτιο του 2004 έως τον Νοέμβριο του 2005 και παρήγαγαν MBL υποβλήθηκαν σε έλεγχο με PCR και μελέτη νουκλεοτιδικής αλληλουχίας, μοριακή τυποποίηση με Rep-PCR, και χαρακτηρισμό του πλασμιδιακού DNA μετά από πέψη με S1 νουκλεάση. Πραγματοποιήθηκαν πειράματα σύζευξης και ισοηλεκτρικής εστίασης για την ανίχνευση συνυπαρχουσών β-λακταμασών. Μεταξύ 23 ασθενών, 12 υπέστησαν μία ή περισσότερες κλινικές λοιμώξεις. Συνολικά μελετήθηκαν 82 στελέχη που αντιπροσώπευαν ένα στέλεχος από κάθε κλώνο, πηγή και ασθενή και περιελάμβαναν στελέχη Klebsiella pneumoniae (77), Enterobacter cloacae (2), Citrobacter freundii (1) και Pseudomonas aeruginosa (2). Μεταξύ των στελεχών K. pneumoniae παρατηρήθηκαν 10 διαφορετικοί κλώνοι. Τα πειράματα βακτηριακής σύζευξης ήταν επιτυχή στο 54.5% των στελεχών K. pneumoniae και ανιχνεύθηκαν 5 διαφορετικού μεγέθους πλασμίδια. Όλα τα στελέχη K. pneumoniae και E. cloacae μοιράζονταν το ίδιο ιντεγκρόνιο τάξεως 1 που εκτός του γονιδίου blaVIM-1 έφεραν τις γονιδιακές κασέτες aacA7, dhfrI και aadA1. Το στέλεχος C. freundii έφερε ένα διαφορετικό ιντεγκρόνιο που περιελάμβανε τα γονίδια blaVIM-1 και aac(6’)-IIc. και τα δύο στελέχη P. aeruginosa έφεραν το γονίδιο blaVIM-2. Δεν κατέστη δυνατό να αναγνωρίσουμε κάποιους κλώνους με ιδιαίτερη ικανότητα να προκαλούν κλινική λοίμωξη. Συμπερασματικά, στελέχη διαφορετικών κλώνων που παρήγαγαν MBL ήταν υπεύθυνα για τα πρώτα περιστατικά αποικισμού ή/και λοίμωξης στην ΜΕΘ. Ένα ιντεγκρόνιο, κοινό στα Ελληνικά νοσοκομεία, μεταφέρθηκε επιτυχώς μεταξύ μικροβιακών ειδών και κλώνων οδηγώντας στο συμπέρασμα ότι η επιδημία ήταν αποτέλεσμα κυρίως της επιτυχούς οριζόντιας μεταφοράς κινητών γενετικών δομών παρά αποτέλεσμα της οριζόντιας μεταφοράς ενός ή περισσότερων κλώνων.
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Cite
Citations (0)
Μελετήθηκε η μοριακή επιδημιολογία των Εντεροβακτηριακών στελεχών που παράγουν μεταλλο-β-λακταμάσες (MBLs) της ομάδας των VIM που απομονώθηκαν στην αρχή της επιδημίας στην Μονάδα Εντατικής Θεραπείας του Πανεπιστημιακού Γενικού Νοσοκομείου «ΑΤΤΙΚΟΝ». Όλοι οι Gram-αρνητικοί μικροοργανισμοί που απομονώθηκαν από τον Μάρτιο του 2004 έως τον Νοέμβριο του 2005 και παρήγαγαν MBL υποβλήθηκαν σε έλεγχο με PCR και μελέτη νουκλεοτιδικής αλληλουχίας, μοριακή τυποποίηση με Rep-PCR, και χαρακτηρισμό του πλασμιδιακού DNA μετά από πέψη με S1 νουκλεάση. Πραγματοποιήθηκαν πειράματα σύζευξης και ισοηλεκτρικής εστίασης για την ανίχνευση συνυπαρχουσών β-λακταμασών. Μεταξύ 23 ασθενών, 12 υπέστησαν μία ή περισσότερες κλινικές λοιμώξεις. Συνολικά μελετήθηκαν 82 στελέχη που αντιπροσώπευαν ένα στέλεχος από κάθε κλώνο, πηγή και ασθενή και περιελάμβαναν στελέχη Klebsiella pneumoniae (77), Enterobacter cloacae (2), Citrobacter freundii (1) και Pseudomonas aeruginosa (2). Μεταξύ των στελεχών K. pneumoniae παρατηρήθηκαν 10 διαφορετικοί κλώνοι. Τα πειράματα βακτηριακής σύζευξης ήταν επιτυχή στο 54.5% των στελεχών K. pneumoniae και ανιχνεύθηκαν 5 διαφορετικού μεγέθους πλασμίδια. Όλα τα στελέχη K. pneumoniae και E. cloacae μοιράζονταν το ίδιο ιντεγκρόνιο τάξεως 1 που εκτός του γονιδίου blaVIM-1 έφεραν τις γονιδιακές κασέτες aacA7, dhfrI και aadA1. Το στέλεχος C. freundii έφερε ένα διαφορετικό ιντεγκρόνιο που περιελάμβανε τα γονίδια blaVIM-1 και aac(6’)-IIc. και τα δύο στελέχη P. aeruginosa έφεραν το γονίδιο blaVIM-2. Δεν κατέστη δυνατό να αναγνωρίσουμε κάποιους κλώνους με ιδιαίτερη ικανότητα να προκαλούν κλινική λοίμωξη. Συμπερασματικά, στελέχη διαφορετικών κλώνων που παρήγαγαν MBL ήταν υπεύθυνα για τα πρώτα περιστατικά αποικισμού ή/και λοίμωξης στην ΜΕΘ. Ένα ιντεγκρόνιο, κοινό στα Ελληνικά νοσοκομεία, μεταφέρθηκε επιτυχώς μεταξύ μικροβιακών ειδών και κλώνων οδηγώντας στο συμπέρασμα ότι η επιδημία ήταν αποτέλεσμα κυρίως της επιτυχούς οριζόντιας μεταφοράς κινητών γενετικών δομών παρά αποτέλεσμα της οριζόντιας μεταφοράς ενός ή περισσότερων κλώνων.
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Cite
Citations (0)
The ampD gene product regulates the expression of AmpC beta-lactamase in gram-negative bacteria and is proposed to be involved in peptidoglycan metabolism. In this study, we sequenced the ampD wild type and three mutant genes of Enterobacter cloacae and Citrobacter freundii. They exhibited a high degree of homology with the corresponding gene of Escherichia coli except in the carboxy termini, where, in the wild-type genes of E. cloacae and C. freundii, four additional amino acids yielding the Ser-X-X-Lys motif were found. Evidence that this C-terminal region of the ampD gene product is necessary for activity was shown by constructing a deletion of the last 16 amino acids. The spontaneous mutation of ampD02 is an out-of-frame insertion and yields an inactive AmpD protein. The single-base-pair substitution of Gly for Asp-121 in ampD05 is responsible for a hyperinducible phenotype. These results demonstrate regions of the ampD gene and the corresponding protein which have functional importance for the induction of AmpC beta-lactamase in E. cloacae.
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Wild type
Cite
Citations (45)
Abstract. Motaweq ZY. 2022. Prevalence of ?-lactamase produced in Klebsiella pneumoniae and Enterobacter cloacae isolated from gingivitis in Al-Najaf Province, Iraq. Nusantara Bioscience 14: 78-83. This study provides phenotypic and genotypic ?-lactamase formation data on 26 isolates of Klebsiella pneumoniae and Enterobacter cloacae isolated from patients suffering from gingivitis checked at Al-Kafeel clinic and private clinic in Al-Najaf Province-Iraq during the period from September 2020 to February 2021. In this study, some of them were detected by traditional phenotypic methods, while others were detected by phenotypic and then genotypically by using monoplex-PCR technique. The results revealed that out of 14 ?-lactam resistance K. pneumoniae isolates, 8 isolates (57.1%) gave positive results with the direct capillary tubes method, while 12 ?-lactam resistance E. cloacae gave 6 (50%) positive results. This result indicated that the enzymatic resistance was prevalent among isolates. Furthermore, the results showed that most isolates were ESBL producers according to initial and confirmatory methods. Molecular amplification of the ?-lactamase enzyme blaSHV gene was detected in 8 (57.1%) and 5 (41.6%) for K. pneumoniae and E. cloacae, respectively. While all 100% of K. pneumoniae and E. cloacae isolates gave negative results for blaGES gene. This study aimed to investigate the ?-lactamase formation and detection of blaSHV and blaGES genes in K. pneumoniae and E. cloacae isolated from gingivitis diseases.
Enterobacter cloacae
Beta-lactamase
Cite
Citations (2)