Caractérisation biomoléculaire et structure de la population des cobayes de la zone agro-écologique à pluviométrie bimodale du Cameroun

En vue de caracteriser la diversite genetique des populations de cobayes domestiques (Cavia porcellus) dans la region agro-ecologique du Cameroun, un panel de16 marqueurs microsatellites ont ete utilises. L’ADN genomique provenait de 110 prelevements sanguins obtenus chez des animaux non apparentes des elevages accessibles de la region d’etude, en tenant compte de deux groupes selon les origines, soit le Centre et l’Est. Nos resultats ont montre que les marqueurs microsatellites etaient tres polymorphiques. Il a ete observe une deviation a l’equilibre de Hardy Weinberg, a l’exception du marqueur Cavy 4.Un total de 11 alleles a ete identifie dans les l2 sous populations, soit 5,15 dans le groupe de l’Est et 5,54 pour le groupe du Centre. Tous les locus ont ete hautement polymorphiques (100%). Selon les analyses, 3% de la diversite genetique observee serait due aux differences entre sous populations, cependant que 35% de la meme diversite serait due aux differences intra sous-populations et 62% aux differences entre individus de la population totale. La distance genetique entre les deux sous populations etaient relativement faible (0.041) et suggererait une separation relativement recente. La consanguinite etait tres importante, 28,5% et 33,3%, respectivement pour les sous populations de l’Est et du Centre. L’heterozygotie variait entre 0,446± 0,071 pour l’Est 0,510 ± 0,062 pour le Centre. L’index de fixation variait entre 0,393 ± 0,069 et 0,285 ± 0,089, respectivement pour le groupe du Centre et de l’Est. L’arborescence phylogenetique et la structure de la population totale ont fait apparaitre 3 sous populations genetiques distinctes dans la region agro-ecologique bimodale du Cameroun. Ces resultats preliminaires ouvrent des voies pour des schemas d’amelioration genetique du cobaye domestique au Cameroun. Mots cles: Diversite genetique, Cobayes, Microsatellites, Cameroun.