Diagnostique genetique utilisant une analyse de variant a multiples sequences

La presente invention concerne le domaine de l'analyse genetique a base d'acide nucleique, et porte notamment sur de nouvelles interospections de la structure globale de la variation genetique dans toutes les especes vivantes. Cette structure peut etre mise en evidence avec l'utilisation d'un ensemble de donnees de variants genetiques issus d'un locus particulier. L'invention est utile pour definir le sous-ensemble de variations qui sont plus appropriees comme marqueurs genetiques pour rechercher des correlations avec certains caracteres phenotypiques. De plus, les interospections sont utiles dans le developpement des algorithmes et des programmes informatiques qui convertissent ces donnees genotypiques en haplotypes constituants qui sont penibles et couteux afin de deriver vers une voie experimentale. L'invention est utile dans des domaines tels que (i) des etudes de liaison sur tout le genome, (ii) un diagnostic clinique in vitro, (iii) l'amelioration genetique des populations animales ou vegetales, (iv) l'identification de micro-organismes.