엽록체 IGS 구간 염기서열 분석에 따른 쑥속 종판별

쑥속(Artemisia)은 국화과(Asteraceae; Compsitae) 다년생 초본으로 국내 약 40종이 자생하고 있으며 대부분 잎 또는 전초를 건조하여 차(茶)로 음용하거나 한약재로 사용한다. 일반적으로 쑥(애엽)은 따뜻한 성질을 가지지만 약용으로 주로 사용되는 개똥쑥, 더위지기(한인진), 사철쑥(인진쑥, 인진호)의 경우에는 반대로 차가운 성질을 나타내므로 이들을 식·약용으로 사용할 경우 종을 명확하게 구분할 필요가 있다. 본 연구는 DNA 바코딩 기술을 활용하여 여러 쑥속 자원들 중 더위지기와 사철쑥의 종판별을 위한 CAPS (PCR-RFLP) 마커를 개발하기 위해 수행되었다. 엽록체 IGS 중 atpF-atpH 및 psbK-psbIintergenic spacer 구간을 대상으로 BioEdit 7.2.5 software를 이용하여 염기서열 차이를 분석함으로써 종간 SNP와 InDel 마커를 확보한 뒤 CAPS 전환 가능성을 검토하였다. 이 후 서열 특이적 프라이머 쌍(Artm-FH 및 Artm-KI)을 제작한 뒤 증폭한 PCR 산물에 각각에 상응하는 제한효소를 처리하였다. Artm-FH로 증폭된 PCR 산물에 XapI (5‘-R^AATTY-3’)을 처리한 결과, 사철쑥에서 411 bp와 69 bp크기의 두 개 단편이 관찰되었고 XapI 인식부위가 존재하지 않는 더위지기의 경우 480 bp 위치에서 단일 증폭산물이 검출되었다. Artm-KI로 증폭된 PCR 산물에 Eco57I (5’-CTGAAGN16^-3’/3’-GACTTCN14^-5’)를 처리한 결과, 사철쑥에서 317 bp, 240 bp 및 77 bp 크기의 세 개 절단 산물이 확인됨에 따라 이형접합으로 간주되었고 이는 기 수행된 핵 리보솜 ITS2 서열 분석결과에서도 입증되었다. 본 연구결과를 시중에 유통되고 있는 쑥 유래 제품에 적용한다면 원료에 대한 안전성이 확보될 수 있을 뿐만 아니라 해당 연구 기술은 다양한 목적의 종판별 연구에 유용할 것으로 판단된다.