Biología molecular en el diagnóstico de la infección respiratoria aguda de origen bacteriano

Los metodos de diagnostico bacteriologico empleados tradicionalmente en las infecciones respiratorias agudas (IRA) tienen limitaciones de sensibilidad (cultivo, deteccion directa de antigenos, etc.), o requieren un tiempo prolongado para obtener resultados (aparicion de anticuerpos). En los ultimos anos, se han desarrollado tecnicas de amplificacion de acidos nucleicos (TAAN) que permiten la deteccion de dianas geneticas especificas de cada patogeno en muestras clinicas. Estas tecnicas han mostrado ser mas sensibles que el cultivo o la deteccion directa y, a diferencia de las serologicas, trabajan eficazmente en fase aguda. Sin embargo, tienen limitaciones, como la presencia ocasional de inhibidores de la amplificacion en muestras clinicas, la persistencia de Mycoplasma pneumoniae o Chlamydophila pneumoniae en la mucosa de algunas personas, y en la diferenciacion entre infeccion patogena y colonizacion en el caso de bacterias que forman parte de la flora habitual de la via respiratoria ( Streptococcus pneumoniae , etc.). Las recientemente desarrolladas TAAN en tiempo real han generado expectativas de resolver algunos de estos problemas, al poder cuantificar la carga bacteriana. En el diagnostico etiologico de la IRA debida a S. pneumoniae , las TAAN siguen estando esencialmente en el campo de la investigacion. En el caso de M. pneumoniae y C. pneumoniae , su combinacion con la serologia mejora la capacidad diagnostica. Estos metodos son sensibles y especificos para detectar Legionella ; sin embargo, su utilidad practica esta por establecer, a la espera de una valoracion en relacion con la antigenuria. Actualmente, son una alternativa ventajosa para Bordetella pertussis , pero de momento no tienen utilidad en la infeccion aguda por Coxiella burnetii.