大薯病程相关蛋白1(PR1)基因及其启动子序列的克隆与分析
2018
为了研究大薯 DaPR 基因的表达模式及调控机理,本研究 利用逆转录聚合酶链式反应 (RT-PCR) 技术,从高抗炭疽病大薯材料 Da94 中获得 1 个 病程相关蛋白 1 (pathogensis-related protein 1, PR1) 基因,命名为 DaPR1 。测序显示该基因包含长度为 501 bp 的完整开放阅读框 (ORF) , 预测编码 166 个氨基酸。生物信息学分析表明该基因编码的蛋白具有典型 SCP-PR1-like 保守结构域, Blast 比对表明 DaPR1 蛋白与多种植物的 PR1 蛋白高度同源。 实时荧光定量 PCR 检测表明, DaPR1 基因在高抗种质中受炭疽菌显著诱导,在侵染 48 h 时其相对表达量达到最大。通过 巢式PCR扩增 DaPR1 上游转录调控序列的 5' 端, 获得 1 203 bp 的 DaPR1 基因启动子,序列分析表明该区域除了含有基础的启动子元件 CAAT-box 和 TATA-box 外,还存在茉莉酸 (JA) 、赤霉素 (GB) 等激素响应元件及真菌诱导响应元件 (W-box) 。 本研究通过克隆和分析 DaPR1 基因及其启动子序列,为进一步研究该基因的功能及其表达调控机制奠定了基础。
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