Atomic force microscopy analysis of orientation and bending of oligodeoxynucleotides in polypod-like structured DNA

我们以前证明象多足一样组织了 DNA，或 polypodna，与三或更构造了 oligodeoxynucleotides (ODN ) ，被象树枝状的房间和巨噬细胞那样的有免疫力的房间高效地收起，取决于它的结构的复杂性。包括 polypodna 的 ODN 应该弯曲形成象多足一样结构，并且可以那么由采用 bendtype 符合构造或跨类型的符合构造做。这里，我们试着阐明取向并且用原子力量显微镜学(AFM ) 在 polypodnas ODN 弯曲。我们设计了 pentapodnas 的二种类型(即，有五个豆荚的 polypodna ) 使用 60- 到 88 底 ODN，它然后在 DNA origami 上被使不能调动装裱。AFM 成像证明在 pentapodna 的 ODN 采用了拐弯类型符合构造。当他们在非强迫的条件下面在框架上被使不能调动时， Tetrapodna 和 hexapodna 也采用了拐弯类型符合构造。这些调查结果提供向协调设计的有用信息，和 structureactivity 关系为，许多 DNA nanostructures。