Phylogéographie, taxonomie et évolution morphologique de troix complexes d'espèces de musaraignes du genre Crocidura (Mammalia, Soricomorpha) en Afrique subsaharienne

Les objectifs de cette these etaient : de tester l’efficacite du code-barres moleculaire COI comme outil taxonomique chez les musaraignes d’Afrique subsaharienne ; de resoudre certains problemes taxonomiques dans le genre Crocidura Wagler, 1832, grâce a une demarche integrative ; de retracer l’histoire evolutive chez trois complexes de ce genre a la lumiere des evenements climatiques du Plio-Pleistocene ; de degager certaines grandes tendances evolutives de taille et de conformation chez les musaraignes. Afin de repondre a ces questions, nous avons utilise des donnees moleculaires (trois marqueurs mitochondriaux et quatre marqueurs nucleaires) et des donnees morphologiques (caracteres externes), morphometriques (mesures externes) et de geometrie morphometrique (points reperes 2D sur la face palatale du crâne). Une etude menee sur les musaraignes vivant en sympatrie sur le Mont Nimba (Guinee) nous a montre que le code-barres moleculaire COI pouvait etre considere comme un outil taxonomique efficace. Le marqueur cytb a montre une efficacite semblable. L’exploration moleculaire des trois complexes d’especes C. Obscurior, C. Olivieri et C. Poensis a revele l’existence d’une diversite cryptique importante. La realisation d’analyses de geometrie morphometrique sur les crânes nous a permis d’inclure les specimens types. Grâce a cette demarche integrative, de nouvelles propositions taxonomiques ont ete faites. Une etude biogeographique comparative nous a montre que l’histoire evolutive des taxons forestiers C. Obscurior, C. Goliath, C. Poensis, C. Buettikoferi et C. Grandiceps avait ete fortement influencee par les oscillations climatiques du Plio-Pleistocene (depuis 3,5 Ma) et etait congruente avec la theorie des refuges forestiers. L’isolement de populations dans des ilots forestiers durant les phases arides a ete un moteur de speciation allopatrique et de diversite intraspecifique. Nos resultats ont egalement confirme le role des rivieres en Afrique subsaharienne comme moteur de diversification. La theorie des gradients environnementaux nous a egalement permis de comprendre la diversification au sein des complexes C. Olivieri et C. Poensis. Des evenements de speciation se sont produits dans les zones d’ecotone, en particulier a la limite entre foret et savane et entre foret de montagne et de plaine. La encore, les oscillations climatiques du Plio-Pleistocene ont joue un role important en entrainant un deplacement des limites ecoregionales et favorisant ainsi un deplacement de niche ecologique. Nos donnees nous ont permis de comprendre l’histoire evolutive de C. Olivieri, espece originale au sein du genre Crocidura en raison de sa large distribution et de sa tolerance a une grande variete d’habitats. Cette espece issue d’une population ancestrale habitant les forets du bassin du Congo se serait adaptee a un large eventail d’habitats et se serait ainsi etendue a une grande partie du continent africain. Les analyses morphometriques nous ont permis de comprendre certaines tendances evolutives de taille et de forme chez les musaraignes. Un maintien d’une taille miniature est observe chez le complexe C. Obscurior. Au contraire, une convergence evolutive vers une taille geante est observee chez C. Goliath et C. Nimbasilvanus, respectivement en Afrique centrale et en Afrique de l’Ouest. Ces patrons d’evolution pourraient s’expliquer par une competition interspecifique importante dans les forets d’Afrique tropicale. L’acquisition de ces tailles extremes permettrait un acces a des ressources alimentaires differentes au sein d’une niche ecologique tres peuplee. Malgre des variations de taille importantes chez C. Goliath, accompagnees de modifications allometriques de la boite crânienne, la rangee dentaire montre une grande stabilite. Cette tendance pourrait s’expliquer par les contraintes evolutives associees au mode alimentaire des musaraignes.