大肠杆菌O11 O-抗原基因簇序列的破译及特异分子标识的鉴定

大肠杆菌O11是一种可在人畜间交叉传染的强致病菌，具有潜在流行性爆发的危险。现完成了O11 O-抗原基因簇的破译，筛选和鉴定了多种特异分子标识，并实现了对大肠杆菌O11的快速、灵敏和准确的分子分型检测。利用鸟枪法测定大肠杆菌O11 O-抗原基因簇的序列全长为14180bp，生物信息学方法分析序列结构，共发现12个基因：GDP-L型岩藻糖合成途径基因（gmd，fcl，gmm，manC，manB）、UDP-N乙酰葡萄糖C4异构酶基因（gne）、O-抗原转运酶基因（wzx）、O-抗原聚合酶基因（wzy）和4个糖基转移酶基因；用PCR方法筛选出2个针对大肠杆菌O11的特异基因和4对特异引物，并进行环境样品检测实验鉴定了该PCR检测方法的灵敏度；设计并筛选出8条针对大肠杆菌O11的特异探针。