Computational identification and evolutional analysis of Piwi subfamily in 11 Drosophila species

11 果蝇种类的完全的染色体序列提供一个机会在密切相关的种类调查基因家庭进化。包括三个成员， piwi， Aub 和 Ago3，当它参予纡子 A 的生物的续生说，果蝇 Piwi 亚科吸引了增加的注意。这里，我们从 11 果蝇种类的染色体识别了 33 个 Piwi 相当或相同的事物。piwi 和 Aub 基因的全身的 cDNA 序列被使用新 GENSCAN 网服务者获得。因为他们有长 introns， Ago3 相当或相同的事物关于全身的信息是困难的。Piwi 亚科基因的 genomic 结构高度在多样的果蝇种类之中被保存。昆虫 piwi 和 Aub 基因长有第一 introns。第一 intron 的平均长度为 Aub 是为 piwi 和 840 bp 的 1 284 bp，它比另外的 introns (为 Piwi 的 93 bp 和为 Aub 的 54 bp ) 的那些大得多。然而，这现象没在哺乳动物的 piwi 基因被观察。我们也发现在前 ons 和昆虫 Ago3 基因的 introns 有丰富的重复序列。由于在四果蝇种的长终端重复元素的最近的插入，比邻近的前 ons 和另外的 introns 第三 introns 展览分开更高的保存。最小的进化方法创造的一棵进化的树显示哺乳动物的 piwi 基因与昆虫 Ago3 Piwi 亚科有关仔细是更多。