Helicobacter pylori : identification and detection of clarithromycin resistance by polymerase chain reaction

Helicobacter pylori est un bacille a Gram negatif spirale, aujourd'hui bien reconnu comme largement implique dans la maladie ulcereuse gastro-duodenale, ainsi que dans l'adenocarcinome gastrique et le lymphome gastrique du Malt [1]. Les methodes de diagnostic de l'infection sont nombreuses. A cote de techniques non invasives, serologie et test respiratoire a l'uree marquee, d'autres necessitent la realisation d'une endoscopie et le prelevement d'une biopsie gastrique : test a l'urease, histologie, culture bacterienne (permettant de plus de tester la sensibilite aux antibiotiques de la souche) et polymerase chain reaction (PCR) [1] (la PCR peut neanmoins aussi etre realisee a partir du liquide gastrique). Les methodes d'amplification genique, comme la PCR, ont la sensibilite theorique la plus grande, notamment superieure a celle de la culture bacterienne. Toutefois, elles ont un inconvenient majeur, celui de ne pas permettre de predire la sensibilite aux antibiotiques de la souche [1], ce qui peut s'averer genant puisque des resistances acquises peuvent etre en cause dans des echecs du traitement d'eradication. La clarithromycine est l'antibiotique considere a l'heure actuelle comme la cle de voute du traitement d'eradication. Le traitement de premiere ligne recommande en France associe en effet deux antibiotiques (clarithromycine et amoxicilline) a un antisecretoire gastrique de type inhibiteur de la pompe a protons) [1]. En cas de resistance a la clarithromycine, le metronidazole peut constituer une alternative.