芝麻COX VIIa基因克隆、表达与特征分析

2019 
为获得芝麻细胞色素氧化酶 喻a 亚基基因及其蛋白质序列特征,研究其组织表达特性以及可能的功能。本研究利用 NCBI 数据库中注释的芝麻 COX 喻a 基因序列,设计特异 PCR 引物,以 RT-PCR 技术进行克隆和表达分析,并利用生物信息学方法分析其序列特征,预测其蛋白质亚细胞定位、跨膜结构和三级结构等。结果表明,克隆的芝麻 SiCOX 喻a1 和 SiCOX 喻a2 基因的 cDNA 序列长度分别为 481 bp 和 416 bp ,二者 编码的蛋白质序列长度为 67 个氨基酸残基,具有 88% 的相似性,属于同源蛋白,均定位于线粒体中,在蛋白序列中 35~57 aa 形成一个跨膜螺旋区;预测的 SiCOX 喻 a 三级结构均由 2 段 琢 - 螺旋结构组成,但 SiCOX 喻 a2 与 SiCOX 喻 a1 序列的 C 端形成的高级结构存在较小的差异。表达分析表明,二者在芝麻花蕾、花冠、根、茎和叶中均有表达,且表达模式相似,均在生长旺盛的组织中高丰度表达。本研究为揭示芝麻 COX 蛋白复合物的结构和功能提供了理论指导。
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