马尾松 PmTIR1 基因的克隆及编码蛋白质的结构预测

TIR1 (transport inhibitor response 1)基因在生长素信号转导途径中发挥重要作用。本研究采用PCR技术和RACE技术，利用Primer Premier5进行引物设计，从马尾松中克隆出TIR1基因的全长cDNA序列，命名为 PmTIR1 。此cDNA全长2 446 bp，包括1 725 bp完整的ORF，能够编码含有574个氨基酸的蛋白，此蛋白相对分子质量为64 240.3 u，等电点为6.76。利用ClustalX、ANTHEPROT和DNAMAN等软件分析 PmTIR1 序列及其编码的氨基酸序列，结果表明：马尾松PmTIR1蛋白氨基酸序列与火距松TIR1蛋白同源性高达99％，PmTIR1蛋白含有F-box结构域和多个LRR结构域；PmTIR1蛋白的F-box结构域可能与SCFTIR1中SKP1结合，它符合F-box家族的特点。利用实时定量技术得知 PmTIR1 在马尾松嫩根、嫩茎、嫩叶中都有表达，在嫩叶中表达量最高、嫩根中次之、嫩茎中最低。本研究可为生长素调控马尾松生长发育相关机理提供理论依据。