Apport de l'observation microscopique couplée à l'analyse d'images dans l'évaluation de la qualité bactériologique des eaux : approche cellulaire globale

Le role important des bacteries dans les ecosystemes aquatiques necessite leur denombrement d'une maniere plus totale que leur seule quantification par les methodes traditionnelles de culture. L'utilisation de l'observation microscopique en epifluorescence assistee par analyse d'images permet d'une part un denombrement des cellules totales qui met en evidence de tres grandes differences entre les abondances cellulaires bacteriennes totales et celles des cellules bacteriennes cultivables. Par des reactions specifiques il est possible de qualifier sur le plan de la viabilite les cellules bacteriennes non cultivables en mettant en evidence plusieurs parametres de leur etat physiologique comme l'activite de leur chaine respiratoire, de leur metabolisme, l'evaluation du niveau de la fluorescence de leur ADN (permettant une quantification ou qualification de celle-ci), enfin l'integrite de leur membrane cellulaire. Apres presentation de quelques resultats portant sur differents milieux aquatiques eventuellement dans des conditions stressantes pour certains, il apparait que l'observation microscopique en epifluorescence, assistee par un analyseur d'images teste dans cette etude, est une methode de choix pour un denombrement automatise et fiable et pour la qualification des cellules bacteriennes non cultivables en termes de viabilite.