水稻苗期低温失绿基因cisc(t)的精细定位及其候选基因的确定

2010 
籼稻品种Dular在低温条件下幼苗会表现失绿.前期遗传研究表明,这种低温失绿的表型是由一个隐性基因控制的,该基因初步定位在第9染色体长臂的SSR标记RM257和RM242之间,将该基因暂命名为cisc(t).本研究在前期初步定位的基础上,利用粳稻品种Lemont(低温条件下幼苗表现正常绿色)与Dular杂交,构建了一个很大的F2群体,将cisc(t)基因精细定位在一个12kb的区间内.该区间只含有一个注释基因,编码一个三角状五肽重复区(PPR)蛋白.测序结果表明,Dular在该基因的第60位碱基处缺失了8个碱基,造成移码突变而失去正常功能.这与Dular表现白化突变表型相吻合.而且,前人研究表明,许多植物的幼苗失绿突变性状与PPR蛋白有关.因此,将该基因确定为cisc(t)的候选基因.
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