Genome-wide differences in hepatitis C- vs alcoholism-associated hepatocellular carcinoma

瞄准：在西方的欧洲在肝细胞癌看病原学依赖者基因畸形的一幅全面图画。方法：与一个面向肝的微数组，抄本层次与肝细胞癌从病人的一个训练集合在小瘤和肝硬化被作比较(酒精中毒， 12；丙肝， 10 ) 并且 5 控制。有反常丰富的增进知识的抄本的松开或紧密的选择是统计上有效的，紧选择的抄本被 qRTPCR 下次从我们的训练集合在小瘤确定(12 + 10 ) 并且一个测试集合(6 + 7 ) 。结果：在染色体 8 上指向重要基因在表示上的 475 个抄本(酒精中毒) 或 -2 (丙肝) 和本体论的一种选择在房间周期规定，抄写因素和干扰素显示了占优势的煽动性的回答(酒精中毒) 或变化应答的海角(丙肝) 。其病原学之间的差别在小瘤然而并非在肝脏硬化症的织物重要的 23 个抄本的一种紧选择显示上述 dysregulations 发生在肿瘤然而并非在包围肝硬化。这 23 个抄本根据病原学分开了我们的测试集合。联系发炎的抄本在酒鬼对丙肝肿瘤指向了免费的铁新陈代谢的有限改变。结论：病原学特定的畸形(染色体偏爱；在 transcriptomes 和相关功能的差别) 在酒精中毒或丙肝驾驶的肝细胞癌被识别了。这可以在这疾病为微分治疗打开新奇大街。