Structural basis of ligand recognition at free fatty acid receptors

Diese Arbeit verfolgt das Ziel, ein tieferes Verstandnis fur strukturelle und funktionelle Eigenschaften der Free Fatty Acid Rezeptoren zu erlangen. Basierend auf dem aktuellen Wissensstand uber diese Rezeptorfamilie wurde mit der Hilfe von gangigen computergestutzten Methoden versucht neue Erkenntnisse zu gewinnen. Homologiemo-dellierung ermoglichte es fundierend auf einer bereits ermittelten Kristallstruktur des Subtyps FFAR1 weitere Modelle der Subtypen FFAR2, FFAR3 und FFAR4 zu generieren. Auf der Grundlage dieser Modelle konnten weitere Experimente durchgefuhrt werden. Eine vergleichende Analyse zwischen FFAR1 und FFAR2 konnte eine Erklarung fur die jeweilige Selektivitat, welche von der Kettenlange der dazugehorigen Fettsaure abhangt, liefern. Docking von sowohl endogenen als auch synthetischen Bindungspartnern fuhrte zur Aufklarung der jeweiligen Bindungsmodi, einschlieslich dem dualen Bindungsmodus von orthosterischen und allosterischen Liganden mit FFAR2. Abschliesende Molekulardynamiksimulationen konnten weitere Details in einem dynamischen Kontext darstellen.