La route des roses

Depuis 2001, je developpe des travaux sur l’etude du determinisme genetique de caracteres d’interet chez le rosier. Ces travaux ont ete menes sur des populations issues de croisements et a partir desquels plusieurs cartes genetiques (marqueurs AFLP, microsatellites et SNP) ont ete construites. Plusieurs caracteres ont ete etudies : remontee de floraison, nombre de petales, date de floraison, composants architecturaux, composants du parfum et plus recemment resistance a la maladie de la tâche noire et nombre d’epines. Ces deux derniers caracteres font l’objet de deux sujets de these que je co-encadre. Pour l’ensemble de ces caracteres, des genes majeurs et/ou QTLs ont ete identifies sur les groupes de liaison des differentes cartes genetiques. La carte genetique haute densite de la population OW a ete utilisee pour l’ancrage du genome du rosier et a permis d’obtenir un genome de bonne qualite comprenant 196 contigs assignes sur les 7 pseudo molecules du genome. En parallele, j’ai participe a l’etablissement d’un protocole de transformation genetique du rosier pour etudier par validation fonctionnelle des genes candidats dans la mise en place des caracteres etudies. Nous possedons un systeme fonctionnel bien qu’encore long et peu efficace. et dont l’efficacite doit etre amelioree Dans le cadre de collaboration avec des partenaires prives, j’ai developpe et dirige plusieurs projets sur l’etude de maladies foliaires du rosier et notamment sur la maladie des tâches noires. Ces travaux nous ont permis de developper une collection de souches de champignons et de montrer que les souches isolees sur rosier sauvage se differenciaient des souches isolees sur rosier moderne. Un test sur boutures en conditions controlees a ete developpe pour etudier la virulence et l’agressivite de ces souches. Ces travaux ont ete en grande partie menes dans le cadre d’encadrement ou co-encadrement de stagiaires, etudiants, CDD et personnels permanents. Comme Anne Sylvestre, j'aime les gens qui doutent