ANALIZA EKSPRESIJE IZBRANIH KANDIDATNIH GENOV POVEZANIH Z RAKOM ŠIROKEGA ČREVESA IN DANKE PRI BOLNIKIH S KRONIČNO VNETNO ČREVESNO BOLEZNIJO IN PRI BOLNIKIH S ČREVESNIMI POLIPI

Izsledki raziskav zadnjih let nakazujejo na povecano tveganje nastanka raka sirokega crevesa in danke (RSCD) pri bolnikih s kronicno vnetno crevesno boleznijo (KVCB). Nasa temeljna predpostavka je bila, da so geni, vpleteni v zgodnjo fazo razvoja RSCD pri bolnikih s KVCB, izraženi na podoben nacin v tkivnih vzorcih polipov SCD in vneti sluznici bolnikov s KVCB. Z bioinformatskimi orodji smo identificirali 5 kandidatnih genov (BAX, IFITM3, COX-2, TLR4 in LRP6) in analizirali njihovo ekspresijo pri bolnikih s KVCB in bolnikih s crevesnimi polipi. Za vsakega bolnika smo analizirali ekspresijo izbranih genov v prizadetem tkivu v primerjavi z normalnim tkivom pri istem bolniku. Za stiri od petih kandidatnih genov (IFITM3, COX-2, TLR4 in LRP6) smo dokazali statisticno znacilno spremenjeno ekspresijo pri bolnikih s polipi SCD in pri bolnikih s Crohnovo boleznijo (CB). V tem smislu smo potrdili hipotezo, da imajo geni, vpleteni v zgodnjo fazo karcinogeneze kronicno vnetega crevesnega tkiva, signifikantno spremenjeno ekspresijo v nevnetem polipoznem crevesnem tkivu pri bolnikih s polipi SCD, kakor tudi v vnetem crevesnem tkivu pri bolnikih s KVCB. Nadalje smo dolocili skupino bolnikov s CB, ki imajo podoben vzorec izražanja izbranih genov kot bolniki s crevesnimi polipi, na podlagi ujemanj v ekspresiji smo ustvarili podskupino bolnikov s CB, ki ima potencialno vecje tveganja za razvoj raka SCD. 60% CB bolnikov ima signifikantno spremenjeno ekspresijo dveh kandidatnih genov, 20% bolnikov s CB ima signifikantno spremenjeno ekspresijo treh kandidatnih genov in pri 5% bolnikov s CB je ekspresija signifikantno spremenjena pri vseh stirih kandidatnih genov. Skupina bolnikov, ki imajo podoben vzorec izražanja izbranih genov imajo verjetno povecano tveganje za zacetek procesov nastanka novotvorb.