Srovnávací topografie telomerových oblastí v lidských buňkách s různými mechanismy prodlužování telomer

Cilem teto diplomove prace bylo porovnani lokalizace telomer a porovnani výskytu TA ve zdravých buňkach, v nadorových buňkach s aktivni telomerazou a v nadorových buňkach s ALT mechanismem prodlužovani telomer. Tyto parametry byly studovany pomoci subtelomerických DNA sond v ramci opakovane dvoubarevne FISH na 2D fixovaných jadrech, dale pomoci HRCM a nasledne softwarove analýzy. Jako modelový material byly zvoleny tyto plicni buněcne linie: WI-38 (zdrave plicni fibroblasty), nadorova linie HT-1080 s aktivni telomerazou a linie WI-38 VA-13/2RA (VA-13) s ALT mechanismem prodlužovani telomer, u ktere existoval předpoklad castějsich TA, pravě z důvodu těsnějsi lokalizace při rekombinacnim prodlužovani telomer. Pro tyto studie byly vybrany chromozomy 2, 4, 8 a 9. Ve větsině připadů byly distribuce radialnich vzdalenosti vsech zkoumaných telomer u vsech tři typů buněcných linii shodne nebo porovnatelne až na par výjimek, mezi ktere patři předevsim výrazný posun polohy obou telomer chromozomu 2 v buňkach HT-1080. Při porovnani poloh obou telomer konkretnich chromozomů ve vsech třech typech buněk se v souladu s dřivějsimi výsledky nalezla centralnějsi poloha telomery q- v porovnani s telomerou p- v připadě chromozomu 9 ve zdravých buňkach WI-38 a dale v připadě chromozomu 2 ve vsech třech typech buněk. Naprosto opacne radialni pozice vsak vykazuji telomery chromozomu 4 ve vsech třech typech buněk a take telomery chromozomu 8 v buňkach WI-38. Na druhou stranu, radialni distribuce obou telomer chromozomů 8 a 9 v buňkach VA-13 a pro chromozom 9 v buňkach HT-1080 jsou v podstatě totožne. U vsech telomer chromozomů 8 a 9 byl potvrzen předpoklad o vyssim podilu telomerických asociaci u buněk s ALT mechanismem prodlužovani telomer oproti buňkam s aktivni telomerazou nebo zdravým buňkam. Obdobně systematický trend se vsak nepotvrdil u telomer chromozomů 2 a 4, kde nejvice telomerických asociaci bylo nalezeno u telomer buněk HT-1080 s aktivni telomerazou.