Identification du gene de la nephronophtise

La nephronophtise est une nephropathie tubulo-interstitielle chronique, autosomique recessive, responsable de 10% des insuffisances renales terminales de l'enfant. Plusieurs affections sont decrites associees a la nephronophtise, la plus frequente etant une atteinte oculaire precoce syndrome de senior-l$$ken (sls). Des etudes familiales de liaison, ont permis de localiser un gene, nph1, en 2q13, et de mettre en evidence une heterogeneite genetique de la maladie, entre les formes avec et sans atteinte oculaire (sls) et au sein meme des formes purement renales. Ce travail de these a porte sur l'identification du gene nph1 par une approche de clonage positionnel, debutant par l'etablissement de la carte physique et genetique de la region. La mise en evidence d'elements repetes dans la region, nous a incite a rechercher d'eventuels remaniements. Des deletions homozygotes d'environ 250 kb ont ete observees chez la plus de 70% des familles, nous permettant de disposer d'un diagnostic rapide et de reduire considerablement l'intervalle contenant le gene. Par une double approche, basee sur le sequencage de la region et la selection d'adnc, nous avons isole un nouveau gene exprime dans le rein. Ce gene code pour une proteine de 732 acides amines contenant un domaine sh3 (src homology 3 domain). La detection de mutations ponctuelles chez des patients portant une deletion heterozygote de la region, nous a permis d'incriminer ce gene dans la nephronophtise. En outre, les donnees du sequencage et la carte de restriction de la region, nous ont permis de preciser les points de cassure des deletions de 250 kb et de caracteriser le mecanisme a l'origine de ce remaniement recurrent. Par ailleurs, les deletions homozygotes de 250 kb, similaires a celles observees chez la majorite des patients avec nephronophtise isolee, et des mutations du gene nph1, ont ete detectees chez cinq patients avec syndrome de cogan (atteinte neurologique rare), chez deux patients avec atteinte oculaire tardive et chez un patient avec syndrome cerebelleux et retard mental modere. Ces resultats suggerent que les mutations du gene observees chez ces patients sont responsables a la fois, de l'atteinte renale et du syndrome de cogan, et dans quelques cas aux atteintes oculaires et neurologiques associees, indiquant un effet pleiotropique du gene nph1.