Circular RNA expression pattern and competing endogenous RNA network involved in rotator cuff tendinopathy

目的: 探究肩袖腱病中差异表达的环状 RNA（circular RNA，circRNA）及其调控靶基因的预测和生物信息学分析。. 方法: 取 2018 年 6 月—2019 年 6 月因冈上肌腱损伤行手术治疗的 10 例患者自愿捐赠肩袖组织，经 MRI、关节镜检查以及组织学染色，确定为正常肩袖或肩袖腱病组织，再依据患者年龄、体质量以及 Bonar 评分进行配对分组。通过高通量测序对肩袖组织进行 circRNA 检测，筛选差异表达的 circRNA，对 circRNA 靶基因进行预测，并进行富集分析和内源竞争 RNA（competing endogenous RNA，ceRNA）网络构建。. 结果: 在 P 2 条件下，共筛选出 94 条在正常肩袖及肩袖腱病组织中差异表达的 circRNA，其中肩袖腱病组织中有 31 条表达上调、63 条表达下调。基因本体（gene ontology，GO）分析发现差异基因最显著富集于环磷酸腺苷应答；京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）通路富集分析发现，差异基因主要富集在细胞外基质-受体交互、蛋白消化及吸收、细胞循环、NF-κB 信号通路等。ceRNA 网络揭示了差异表达的 circRNA 和 miRNA、mRNA 之间可能的相互作用，其中自由能最高的 ceRNA 调控轴为 circRNA.8951-has-miR-6089-DNMT3B。. 结论: 肩袖腱病中存在差异表达的 circRNA，可能与肩袖腱病发生发展密切相关，有望为临床诊断、治疗提供潜在靶点。.