Analysis of microRNA expression patterns in hepatocellular carcinoma and non-tumorous tissues by liquichip assay

目的 运用液相芯片技术研究肝细胞癌(HCC)及毗邻癌旁组织中小分子RNA(miRNA)表达谱差异.方法 常规抽提20例HCC及对照癌旁组织中总RNA,采用含有114种miRNA的液相芯片及配套的Luminex 100检测系统进行miRNA差异表达谱分析;选取部分筛选出的差异表达miRNA,以半定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和Western blot分析其相对应的靶mRNA和目的蛋白表达状况.结果 HCC的miRNA表达谱中差异表达miRNA共有28个,其中上调6个,下调22个,20例标本中共存性差异表达miRNA有9个(上调2个,下调7个,P＜0.01);选取表达明显上调的miR-222作为进一步研究对象,半定量RT-PCR和Western blot分别证实其调节的靶目标-结缔组织生长因子(CTGF)在mRNA水平HCC和癌旁组织中差异无统计学意义,而蛋白质水平在HCC中表达明显下降.结论 液相芯片筛选差异表达miRNA为HCC发病机制和诊断治疗的研究提供了新的思路;miR-18可能通过转录后基因沉默机制抑制CTGF mRNA翻译,从而促进HCC浸润转移。