پایگاههای داده های اصلی جهت مطالعه بیان ژن ها در گیاهان (مطالعه موردی: برنج)

برنج به‌عنوان یکی از مهم‌ترین گیاهان زراعی، کوچک‌ترین ژنوم را در بین غلات دارد و به‌عنوان یک گیاه مدل برای مطالعات ژنتیکی مطرح است. کوچک بودن ژنوم این گیاه باعث شده است که مطالعات جامعی روی آن انجام شود و در نتیجه مقدار زیادی اطلاعات به­دست آید. جمع­آوری و نگهداری مناسب این اطلاعات (داده­ها) و مدیریت هر چه بهتر داده‌های حاصل از آزمایش­های مختلف در قالب یک پایگاه داده­ها، جهت دسترسی محققین به آن­ها برای جلوگیری از دوباره‌کاری و نیز مقایسه نتایج خود با نتایج سایر محققین، از اهمیت ویژه­ای برخوردار است. برای رسیدن به این هدف، می‌توان از بیوانفورماتیک کمک شایان توجهی گرفت. بنابراین، ایجاد و توسعه پایگاه­های داده‌های تخصصی و استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک برای پردازش داده‌ها، سازمان‌دهی کارآمد، تجزیه و تحلیل و تجسم آن‌ها امری ضروری است. در این مقاله، پایگاه‌های داده­های عمده برای مطالعه بیان ژن­ها در سه سطح RNA، پروتئین و متابولوم در گیاه برنج بررسی می­شود و ویژگی‌های این پایگاه‌‌ها برای هر سطح مورد بحث و بررسی قرار می­گیرد.