Bacterial-fungal interactions in wood decay : from wood physicochemical properties to taxonomic and functional diversity of Phanerochaete chrysosporium-associated bacterial communities

Dans les ecosystemes forestiers, la decomposition du bois est un processus majeur, notamment implique dans le cycle du carbone et des nutriments. Les champignons basidiomycetes saprotrophes, incluant les pourritures blanches, sont les principaux agents de cette decomposition dans les forets temperees. Bien que peu etudiees, des communautes bacteriennes sont egalement presentes dans le bois en decomposition et cohabitent avec ces communautes fongiques. L'impact des interactions bacteries-champignons sur le fonctionnement d'une niche ecologique a ete decrit dans de nombreux environnements. Cependant, leur role dans le processus de decomposition du bois n'a ete que tres peu investigue. A partir d'experiences en microcosme et en utilisant une approche non cultivable, il a ete demontre que la presence du champignon Phanerochaete chrysosporium influencait significativement la structure et la diversite des communautes bacteriennes associees au processus de decomposition du hetre (Fagus sylvatica). Par une approche cultivable, cet effet mycosphere a ete confirme, se traduisant par une augmentation de la densite des communautes bacteriennes en presence du champignon ainsi que par une modification de la diversite fonctionnelle de ces communautes. Enfin, une approche polyphasique a ete developpee, combinant l'analyse des proprietes physico-chimiques du bois et des activites enzymatiques extracellulaires. Les resultats de cette experience ont revele que l'association de P. chrysosporium avec une communaute bacterienne issue de la mycosphere de ce dernier aboutissait a une degradation plus importante du materiau bois par rapport a la degradation par le champignon seul, demontrant pour la premiere fois des interactions bacteries-champignons synergiques dans le bois en decomposition