Classification d'échantillons de végétaux pâturés par les ovins en garrigue

Le regime alimentaire des animaux d'elevage qui se nourrissent dans les parcours mediterraneens de garrigue peut comprendre plus de 50 aliments (" plante prise ", PxP) par jour. Sa composition change en fonction des jours et des saisons. Ainsi, une evaluation classique de la valeur nutritive de l'alimentation avec un echantillonnage des fourrages disponibles suivi d'une analyse chimique serait trop difficile, et la grande masse de resultats produit ne serait pas exploitable de facon operationnelle. Nous explorons une methode alternative pour caracteriser la diversite des aliments disponibles en regroupant les echantillons en classes nutritives fonctionnelles par une classification basee sur les spectres. La zone etudiee etait une garrigue mediterraneenne (Corconne, Gard), pâturee par des ovins. En se basant sur le comportement alimentaire des moutons, des prelevements de PxP ont ete effectues sur 3 saisons (Mai 2015, Juin et Octobre 2016). Un total de 358 echantillons a ete collecte, appartenant a 66 especes vegetales. Les echantillons ont ete seches a l'etuve (55°C) et broyes (1mm) avant la collecte des spectres proche infrarouge (NIR, 1100-2500 nm). Les spectres ont ete pretraites (derivee d'ordre 2 ; SNV et detrend) et les bandes correspondant a l'absorption de l'eau ont ete eliminees pour eviter que le classement ne se fasse sur la base de l'humidite residuelle des echantillons. Une classification hierarchique des spectres NIRS a ete effectuee, conduisant a la definition d'un nombre limite de classes. Certaines classes etaient relativement homogenes au plan botanique (par exemple essentiellement des especes de graminees) alors que d'autres rassemblaient des plantes tres diverses au plan botanique, mais ayant une valeur nutritionnelle et / ou des caracteristiques similaires, telles que la nature des organes (jeunes feuilles tendres, tiges lignifiees etc.) ou la presence de composes secondaires comme des huiles essentielles. Cette methode pourrait permettre une meilleure caracterisation de la valeur des parcours pour une exploitation par les animaux. L'enrichissement des bases de donnees par des echantillons collectes dans des milieux divers permettra une plus grande universalite des classes constituees par cette methode. (Resume d'auteur)