水稻低温发芽力 QTL qLTG3-1 基因内分子标记的开发及其在华南籼稻中的应用评价

目的 挖掘低温发芽力优异基因并加以应用，将是水稻低温发芽力育种取得突破的关键。找到功能基因后，利用连锁或基因内的分子标记开展分子标记辅助选择，将极大提高育种过程中性状选择的效率和准确性。 方法 qLTG3-1（Os03g0103300）是最早被克隆的低温发芽力QTL，存在丰富的等位基因变异。设计合适的分子标记对该基因进行分型，并评价其基因型在华南籼稻中与低温发芽力的关系，将有利于在华南稻区利用该基因开展低温发芽力的分子育种。 结果 依据在qLTG3-1中广泛存在的18 bp变异，设计了基因内分子标记Gltg3-1，该标记能特异区分qLTG3-1等位基因之间的18 bp差异；利用该标记对111份华南籼稻进行基因型鉴定，扩增结果为D带型（有18 bp缺失）有51份，R带型（无18 bp缺失）有53份，还有7份为杂合型。依据带型将水稻品种/系分为2组，统计2组品种/系的低温发芽力差异，结果表明组间无显著差异。由于在籼稻中无法根据qLTG3-1的18bp变异判定低温发芽力的强弱，因此在水稻品种改良中需要对不同供体来源的qLTG3-1等位基因的效应进行评价。通过对单片段代换系的低温发芽力鉴定发现，来源于南洋占的qLTG3-1能显著提高华粳籼74的低温发芽力。 结论 在qLTG3-1中广泛存在的18 bp变异与低温发芽力无对应关系；来源于南洋占的qLTG3-1可用于提高水稻低温发芽力的改良，用分子标记Gltg3-1可以在杂交后代中准确地选择目标基因。