ANALYSIS OF GENOTYPE, SUBGENOTYPE AND SEROTYPE OF OCCULT HEPATITIS B VIRUS

Amac: Okult Hepatit B Virus (HBV) enfeksiyonu (Occult HBV infection; OBI) mevcut serolojik testler ile HBV yuzey antijeni (Surface antigen; HBsAg) negatif tespit edilen bireylerin karacigerinde HBV genomunun uzun sureli persistan varligi ile karakterizedir. Bu calismada OBI tanili hastalardan elde edilen HBV’lerin genotip, subgenotip ve subtip profillerinin karakteristiginin irdelenmesi amaclanmistir. Gerec ve Yontem: Calismaya HBsAg negatif farkli klinik endikasyonlar nedeniyle karaciger parankim biyopsisi gerceklestirilen hastalarin karaciger biyopsi orneklerinde Nested PCR yontemiyle HBV DNA varligi tanimlanan 32 OBI tanili hasta ile 17 kronik hepatit B hastasi dahil edildi. HBV S gen MHR bolgesini hedefleyen DNA fragmanlari nested PCR kullanilarak amplifiye edildi. HBV’nin genotip, subgenotip ve subtip/serotiplerinin belirlemek icin Sanger sekans metodu kullanildi. Bulgular: Bu calismada OBI ve kronik hepatit B hastalarindan izole edilen HBV’lerin tumununun genotipi D, subgenotipler sirasiyla HBV/D1 (%75,5), HBV/D2 (%6,1) ve HBV/D3 (%18,4) serotipler sirasiyla ayw2 (%73,5) ve ayw3 (%26,5) olarak belirlenmistir. OBI’li hastalarin %28,1’nin subgenotipi HBV/D3 olarak belirlenmesine karsin kronik hepatit B hastalarinin hic birinde HBV/D3 subgenotipi saptanmamistir. Sonuc: Subgenotip HBV/D3’un viral biyogenezin dinamigi uzerindeki potansiyel etkileri HBsAg negatifligi ve dusuk replikasyon yetkinligi ile karakterize OBI ile iliskili olabilir.