Une nouvelle facette du génome de poule : les genes “longs non-codants"

De recents travaux effectues chez l’homme et des organismes modeles ont montre l’existence massive d’un nouveau type de genes : des genes transcrits en longs ARN (≥ 200 nt) mais ne codant pas de proteine – ces genes sont appeles genes a ARN longs non-codants (ARNlnc). Ces ARNlnc sont une composante majeure du transcriptome et seule une petite fraction de ces ARNlnc est decrite aujourd’hui dans les bases de donnees publiques. Nos travaux sur les ARNlnc de poule ont permis de montrer que le sequencage de transcrits (RNASeq) sur plusieurs replicats biologiques de deux tissus (foie et tissu adipeux) permet de predire un catalogue d’ARNlnc plus exhaustif pour les tissus consideres que ce qui est propose dans les bases de donnees. Nous avons pu confirmer egalement que les caracteristiques des ARNlnc de poule sont similaires a celles decrites chez la souris ou chez l’Homme (transcrits plus courts, moins d’exons, sequences moins conservees entre les especes, expression plus tissu specifique et moins importante que les ARN codant pour des proteines (ARNm)). Nous mettons egalement en lumiere un couple d’ARNlnc et ARNm (DHCR24) adjacent sur le genome et en position divergente dont l’expression est fortement correlee et dont la position est conservee chez l’Homme suggerant un mecanisme de regulation commun via un promoteur dit « bi-directionnel » qui serait implique dans la synthese du cholesterol.