Interacciones moleculares de un flavonoide prenilado con transportadores de antimicóticos dependientes de ATP

2014 
Uno de los principales mecanismos para la resistencia de Candida albicans a azoles es la sobreexpresion de transportadores que extruyen los farmacos antimicoticos y disminuyen su concentracion intracelular. Anteriormente nuestros laboratorios habian informado que el flavonoide prenilado 2', 4'-dihidroxi - 5'-(1'''-dimetilalil)-6-prenil pinocembrina (6PP) inhibe en forma competitiva los transportadores cdr, dependientes del ATP, ademas de ser antimicrobiano per se. En este trabajo realizamos estudios bioinformaticos para analizar los posibles sitios de interaccion molecular estereoespecifica del 6PP, fluconazol y adenosin trifosfato (ATP) con los transportadores cdr1 y cdr2. Se confeccionaron los modelos tridimensionales de los ligandos y de los transportadores a traves de estudios de homologia de datos respecto de otras macromoleculas. Se calculo la variacion de energia libre de Gibbs ( G) asociada a 45 modelos de interaccion molecular y se estudiaron cdr1 y cdr2 en formacomparativa, dada su similitud estructural. Se seleccionaron los modelos mas probables desde el punto de vista termodinamico. El 6PP y el fluconazol podrian competir de diversas maneras por un sitio estereoespecifico que atraviesa la membrana de la levadura. Este sitio, numerado como 1, fue estudiado exhaustivamente, es comun a los transportadores cdr1 y cdr2 y aporta selectivamente distintosaminoacidos. Entre estos ultimos, los de mayor participacion en los modelos de interaccion fueron, en cdr1 y cdr2, respectivamente: PHE 754,756 y TYR 747,749 . Se seleccionaron los 9 mejores complejos formados por cada ligando, de acuerdo a su energia de afinidad decreciente (en KJ/mol en mejor modelo de cdr2: 6PP = -9,3; fluconazol = -6,8). Ademas el flavonoide prenilado competiria con el ATP en el dominio citosolico y con menor probabilidad lo imitaria el fluconazol ( G en KJ/mol en mejor modelo de cdr2: 6P P= -8,2, ATP = -7,6; fluconazol = -6,7)...
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