EXPRESSÃO ALELO ESPECÍFICA EM Coffea canephora ASSOCIADOS À RESISTÊNCIA A NEMATOIDES

O cafe representa uma das principais commodities do mundo, sendo o Brasil considerado o maior produtor mundial de C. arabica e o segundo maior produtor de C. canephora . Entretanto, o parasitismo por nematoides limita o cultivo do cafeeiro, sendo considerado um dos principais fatores responsaveis por perdas na produtividade das lavouras cafeeiras. Dentre os nematoides, o genero Meloidogyne spp. destaca-se como um dos principais, ja que possui uma ampla disseminacao causando inumeros prejuizos. A utilizacao de tecnicas de biologia molecular e analise genomica permitem a identificacao e caracterizacao de genes candidatos a resistencia a nematoides no cafe e oferecem uma alternativa para o controle de doencas, pois esses genes podem ser utilizados como marcadores em programas de melhoramento por selecao assistida. O objetivo do presente trabalho foi identificar a frequencia e os modos de variacao alelica regulatoria atraves de dados de RNAseq de clones de C. canephora previamente caracterizados como resistente e suscetivel a infeccao por nematoides. Analises comparativas do perfil de expressao genica de estudos de RNAseq de RNAs extraidos de raizes do clone 14 de C. canephora (resistente) e do clone 22 (suscetivel) infectadas e nao infectadas por M. paranaensis foram realizadas. A partir dos resultados das analises de RNAseq, genes com dominio NBS-LRR foram identificados como possiveis candidatos. A expressao alelica especifica foi calculada por meio do ASEReadCounter (GATK). Foi possivel identificar a partir das analises de expressao alelica especifica que 74 genes candidatos apresentam especificidade alelica significativa, estes genes ja foram descritos em trabalhos anteriores como relacionados a resposta a estresses bioticos.