Épidémiologie des carbapénémases de 2014 à 2020 : difficiles à traiter ?

Introduction La production de carbapenemases chez les bacteries a Gram negatif est un probleme devenu endemique dans plusieurs regions du monde mais reste sporadique en France. Certaines bacteries sont dites « difficiles a traiter » (difficult-to-treat resistance [DTR]) : il s’agit d’isolats resistants aux fluoroquinolones, betalactamines et carbapenemes. L’objectif de notre travail est d’etudier l’epidemiologie des souches productrices de carbapenemases dans notre hopital depuis 2012 et d’evaluer la proportion de DTR parmi ces souches. Materiels et methodes Nous avons realise une etude retrospective de l’epidemiologie des souches d’enterobacteries et d’Acinetobacter spp. isolees entre mars 2012 et janvier 2020. Du fait d’un changement de logiciel, les donnees de prevalence et l’analyse de la resistance des souches aux autres antibiotiques ont ete realisees sur les enterobacteries isolees a partir du 1er avril 2014. Resultats Depuis 2012, 232 patients porteurs de carbapenemases ont ete inclus dans cette etude. Soixante-dix-huit patients etaient porteurs d’Acinetobacter spp. incluant 75 Acinetobacter baumannii. La resistance aux carbapenemes etait majoritairement mediee par le gene blaOXA-23. Concernant les enterobacteries, 193 patients etaient porteurs de souches secretrices de carbapenemases, incluant 111 (57,5 %) Klebsiella pneumoniae, 39 (20,2 %) Escherichia coli, 16 (8,3 %) Enterobacter cloacae et 27 autres enterobacteries. Le gene blaOXA-48 etait majoritairement retrouve (137 ; 70,9 %), suivi du gene blaNDM (28 ; 14,5 %). Parmi ces 232 patients, 74 etaient infectes a ces germes : 25 % de bacteriemie, 20 % d’infection urinaire et 15 % de pneumopathie. De 2012 a 2018, les patients etaient majoritairement de retour de voyage ou en rapatriements sanitaires des continents africains et asiatiques (53 %). En 2019, l’acquisition en France etait de 71 %, principalement en milieu associe aux soins (78 %). Entre 2014 et 2020, 112 632 souches d’enterobacteries representant 56 516 patients ont ete isolees au laboratoire. Parmi elles, 745 souches (146 patients) etaient productrices de carbapenemases, soit une prevalence de 0,007 %. La proportion de K. pneumoniae etaient de 68,9 % contre 15,8 % d’E. coli et 7,8 % d’E. cloacae. La colistine, l’amikacine et la tigecycline etaient les antibiotiques les plus actifs sur ces souches. La proportion de souches DTR etait de 44,9 % (231/514) pour K. pneumoniae, 31,3 % (37/118) pour E. coli et 29,3 % (29/58) pour E. cloacae. Conclusion La prevalence des carbapenemases reste tres faible, representant moins de 1 % des souches d’enterobacteries isolees au laboratoire. En 2019, les patients infectes et ou colonises par ces souches productrices de carbapenemases provenaient majoritairement de France. La proportion de souches DTR parmi ces souches multiresistantes etait de 38,6 % et il n’existait aucune souche resistante a tous les antibiotiques testes.