基于线粒体12S基因全序列分析我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性

2018 
为了探讨我国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传变异情况及群体遗传结构,采用PCR测序技术测定我国5个地区(华北、华东、华中、西北、西南)绵羊痒螨(兔亚种)线粒体12S基因的全序列,并进行遗传多样性分析。结果共获得89条序列,长度均为657 bp,核苷酸变异位点76个,单倍型50个(H1~H50),单倍型多样性( Hd )与核苷酸多样性( π )分别为0.931 05和0.005 59。进一步分析发现5个地理种群遗传分化程度较弱( F st =0.042 322),基因交流非常频繁( Nm =5.657 372)。中性检验结果均为负值(Tajima's D =-0.928 31,Fu's Fs =-7.066 71),并且差异性不显著( P < 0.05)。构建的NJ树和单倍型网络图均显示绵羊痒螨(兔亚种)5个地理种群的50个单倍型散在分布于不同的支系内,未形成明显的地理分布格局。我国绵羊痒螨(兔亚种)具有较高的遗传多样性,且有一定的遗传分化,基因交流频繁,但未形成以兔品种、温度带和地域来源划分的种群遗传结构。
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