Impact des fluoroquinolones sur la résistance bactérienne dans les microbiotes humains

Les fluoroquinolones (FQ) sont des antibiotiques parmi les plus prescrits au monde. L'augmentation importante des prescriptions de FQ est accompagnee de l'emergence inquietante de la resistance bacterienne responsable d'echecs cliniques et d'emergence de bacteries multi-resistantes. Les FQ diffusent tres bien dans les ecosystemes, expliquant leur impact particulier au niveau des microbiotes. Or, les microbiotes humains constituent un reservoir majeur de la resistance bacterienne. Dans un premier volet epidemiologique, nous avons determine la prevalence du portage de resistance aux FQ dans les differents microbiotes de patients hospitalises ainsi que les taux d'emergence de resistance chez des patients traites par FQ. Nous avons montre que chaque microbiote se comportait de facon independante en termes de facteurs de risque de portage de souches resistantes, comme d'emergence de la resistance sous traitement. Dans une seconde partie, nous avons montre dans le microbiote nasal et intestinal, que l'emergence de la resistance aux quinolones etait un phenomene frequent aux dynamiques variables, essentiellement du a l'acquisition de souches resistantes exogenes. Enfin, nous avons montre que les souches resistantes pouvaient persister dans le tube digestif, parce qu'elles etaient particulierement bien adaptees au commensalisme, leur conferant un avantage selectif. Ceci expliquerait les taux importants de colonisation par des souches de Escherichia coli resistantes aux quinolones dans le microbiote intestinal chez l'homme avec la double consequence d'augmenter les risques de transmission interindividuelle et les risques d'infections par ces souches resistantes.