Differentiation of Pseudomonas avellanae Strains from Greece and Italy by rep‐PCR Genomic Fingerprinting

In order to point out possible genetic differences, 37 Pseudomonas avellanae strains isolated from northern Greece, northern Italy and two different areas of central Italy, were assessed by means of Repetitive PCR (rep-PCR) by using Enterobacteriaceae Repetitive Intergenic Consensus (ERIC) primers. After PCR amplifications, the DNA fingerprints revealed three major groups. The strains from northern Greece and those from the two areas of central Italy were similar showing, in common, three major DNA products ranging from approximately 250 to 1100 base pairs. However, strains from northern Greece can be differentiated from strains of central Italy by the presence of two peculiar PCR products of 800 and 350 base pairs. The strains from northern Italy showed very different PCR profiles. When a dendrogram based on cluster analyses was built up, such strains were very different from the strains from the other areas. Isolations carried out at different times did not affect PCR products. Zusammenfassung Um mogliche genetische Unterschiede feststellen zu konnen, wxirden 37 Pseudomonas avellanae-Stamme aus Nordgriechenland, Norditalien sowie aus zwei Gebieten Zentralitaliens mit Hilfe von rep-PCR und ERIC-Primem untersucht. Nach der PCR-Amplifikation zeigten die DNS-Fingerprints drei Hauptgruppen. Die Stamme aus Nordgriechenland sowie die aus den zwei Gebieten Zentralitaliens waren ahnlich, mit drei Haupt- DNS-Produkten zwischen 250 und 1100 Basettpaaren gros. Die Stamme aus Griechenland konnten jedoch von den ZentralitalienStammen unterschieden werden, da sie zwei ungewohnliche PCR-Produkte von 800 und 350 Basenpaaren hatten. Die Stamme aus Norditalien zeigten ganz andere PCR-Profile. Nach der Erstellung eines Dendrogramms nach einer Clusteranalyse konnte gezeigt werden, das es grose Unterschiede zwischen diesen Stammen und aus anderen Regionen Stammenden Stammen gibt. Isolierungen zu unterschiedhchen Jahreszeiten beeinfiusten die PCR-Produkte nicht.