大鼠尿激酶SYBR Green I real time RT—PCR引物的设计

2007 
设计用于SYBR Green Ⅰ法实时定量逆转录多聚酶链反应(QRT—PCR)检测大鼠尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)mRNA的引物。从基因库获取靶基因及相关序列,充分收集和分析相关生物信息学数据,应用Oligo 6.22设计出一对长度为21bp的引物,其GC含量为52.4%;上下游引物3’最稳定二聚体和及发夹结构的能量分别为-1.5、-0.40kcal/mol和-3.5、-0.90kcal/mol,引物间最稳定二聚体为-3.1kcal/mol。5’端和中间AG值较高,高于3’端AG;引发效率分别455和403。实验证明,该引物能够高效、特异地实现对靶序列的检测,适用于SYBR GreenⅠ法实时定量检测(uPA)mRNA。
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