Amplification des sequences de 11q13 dans les cancers mammaires humains : un exemple d'interface entre biologie des cancers et analyse du genome

La bande q13 du chromosome 11 humain est le siege d'alterations genomiques variees dans divers types de pathologies, notamment tumorales. 11q13 est frequemment amplifiee dans divers cancers humains. Les unites amplifiees en 11q13 dans les cancers du sein presentent des discontinuites pouvant provenir de rearrangements secondaires lies aux etapes successives d'amplification. De plus, nous avons mis en evidence que trois regions de 11q13 peuvent etre amplifiees separement les unes des autres, ce qui suggere l'existence d'au moins trois elements genetiques (proto-oncogenes?) sous-tendant ces evenements d'amplification. La premiere region est definie par le point de cassure bcl1 correspondant aux translocations reciproques t(11q13;14q32). La deuxieme, plus centromerique, est definie par la sonde anonyme d11s97. La troisieme, telomerique cette fois, est revelee par le gene garp. L'etude de la structure des unites amplifiees nous a conduit a un travail de cartographie des marqueurs de 11q13. Lorsqu'on analyse le statut d'amplification de ces marqueurs dans un echantillon de tumeurs amplifiees pour bcl1, on peut comparer d'une maniere statistique leurs profils specifiques d'amplification. Plus deux profils sont semblables, plus grande est la probabilite que deux marqueurs soient proches l'un de l'autre. Parallelement, une cartographie physique utilisant l'electrophorese en champ pulse a ete realisee. Les deux methodes permettent d'etablir une carte de 11q13 qui facilitera la recherche des genes d'interet