兔眼蓝莓组培红色突变株 CHS 基因的克隆与分析

蓝莓Vaccinium spp.果实含有丰富的花青素，但目前对蓝莓花青素合成相关基因的研究还较少。为分析蓝莓花青素合成相关基因，也为今后高花青素含量品种的育种工作提供一定的生物信息学基础，以红色突变兔眼蓝莓Vaccinium ashei为试验材料，采用同源克隆方法，克隆到查尔酮合成酶基因（CHS）的cDNA全长。生物信息学分析表明：该基因cDNA全长1 398 bp，有1个1 170 bp的完整开放阅读框（ORF），编码389个氨基酸。与杜鹃Rhododendron simsii，山茶Camellia japonica，红花油茶Camellia chekiangoleosa，中华猕猴桃Actinidia chinensis，高丛蓝莓Vaccinium corymbosum，苹果Malus domestica的CHS基因同源性分别为90%，83%，83%，83%，83%与82%。兔眼蓝莓CHS基因编码的蛋白不存在信号肽，无跨膜结构域，定位于细胞质中，肽链表现为疏水性，α-螺旋和随机卷曲是其蛋白质二级结构中量最大的结构元件，β-转角和β-折叠散布于整个蛋白质中，对编码的蛋白的结构域预测显示该蛋白含有类似查尔酮合成酶超家族（CHS-like超家族）结构域。由此推测：兔眼蓝莓CHS基因是高度保守的，表达的蛋白为疏水性蛋白，是一种结构和性质都相对稳定的蛋白。