MITE类转座子m Ping 在水稻不同亚种间的差异分析

m Ping 是水稻中第一个被鉴定出的有活性的MITE类转座子，为了探索m Ping 在水稻粳稻品种日本晴和籼稻品种93-11基因组中的分布差异，本研究首先运用Southern杂交的方法初步检测m Ping 在两个亚种中拷贝数的差异，然后通过同源性探寻方法发现，m Ping 在水稻亚种日本晴和93-11基因组中拷贝数分别为52和14，并且日本晴基因组中的m Ping 均为m Ping -1，93-11中m Ping -1的拷贝数为3，m Ping -2的拷贝数为11。通过分析m Ping 上下游5 kb侧翼序列发现m Ping 在日本晴和93-11中分别与23和3个已知基因相关联。本研究为阐明以m Ping 的分布多样性为主要原因的粳稻和籼稻之间的遗传差异提供初步理论基础。