Characterisation of transcribed intergenic Polycomb target sites in mammalian embryonic stem cells

Polycomb-Proteine sind in Drosophila und Vertebraten hoch konserviert und bekannt dafur, dass sie die Genexpression verschiedener kodierender Sequenzen regulieren. Sie konnen die Genexpression reduzieren und dieses Expressionsmuster fur langere Zeitraume beziehungsweise wahrend der Differenzierung beibehalten. Polycomb-Proteine agieren uber sogennante Polycomb Response Elements (PREs). DNA-bindende Proteine konnen in Drosophila bestimmte Sequenzen in den PREs erkennen und an diese binden, wobei sie durch diesen Mechanismus auch Polycomb-Proteine zu den PREs rekrutieren. Die Suche nach Vertebraten-PREs erweist sich als schwierig, da Polycomb-Protein viele verschiedene Isoformen in Vertebraten aufweisen und uber verschiedene Mechanismen Polycomb-Proteine in verschiedenen Geweben rekrutieren konnen. In dieser Studie habe ich mich bemuht zum Verstandnis des Mechanismus von Vertebraten-PREs beizutragen, indem ich transkribierte intergenische Polycomb Zielsequenzen (TIPs) in das Genom von murinen embryonalen Stamzellen integriert und untersucht habe.