بررسی خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه هایPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی بادام در استان خراسان رضوی با استفاده از BOX-PCR

شانکر باکتریایی که بوسیله پاتوار­های Pseudomonas syringae Van Hallایجاد می­شود یکی از مشکلات جدی باغ­های درختان میوه هسته­دار می­باشد. در این تحقیق طی سال­های 1391-1390 نمونه‌های دارای علائم شانکر از باغات بادام در استان خراسان رضوی جمع آوری شده و جداسازی باکتری انجام شد. عامل بیماری براساس آزمون­های گروه LOPAT و GATTa، (Pss)Pseudomonas syringae pv. Syringae  شناسایی شد. شانزده جدایه خالص ­سازی شده و مورد بررسی­های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی قرار گرفتند. جدایه­ها براین اساس اختلافات جزئی نشان دادند. تشخیص مولکولی جدایه ها با واکنش زنجیره ای پلی­مراز با آغازگرهای اختصاصی D21 و D22 صورت گرفت. به منظور ارزیابی دامنه تنوع ژنتیکی جدایه­ها، از روش BOX-PCR استفاده شد. از ضریب تشابه جاکارد (Jaccard) برای تعیین تشابه جدایه­ها و از روش UPGMA و نرم افزار NTYSYS-pc برای آنالیز خوشه­ای استفاده شد. در آنالیز خوشه­ای داده­ها، جدایه­ها با آغازگر BOXA1R در سطح تشابه 68 درصد، در 3 گروه قرار گرفتند. نتایج، بیانگر تنوع ژنتیکی جدایه­های عامل بیماری شانکر درختان بادام در استان خراسان رضوی است.