新疆河狸mtDNA D-loop HV-I区的遗传多样性研究

通过测定和分析我国新疆乌伦古河流域16只河狸的mtDNA D-loop HV-Ⅰ区序列,对新疆河狸的遗传多样性进行了研究。结果表明,新疆河狸mtDNA D-loop HV-Ⅰ区序列长度为569bp, A、T、G和C四种核苷酸的平均比例分别为27.0％、32.7％、24.0％和16.2％,新疆河狸mtDNA D-loop HV-Ⅰ区A+T含量高于G+C含量,表现出碱基组成的偏倚性。与蒙古国河狸mtDNA D-loop HV-Ⅰ区(AY623632)比对后,发现我国新疆河狸mtDNA D-loop HV-Ⅰ区10个变异位点,占分析位点总数的2.03％,其中转换位点4个,颠换位点5个,缺失位点1个,无插入位点。依据GenBank上已公布的不同地区河狸种群mtDNA D-loop HV-Ⅰ区序列,构建系统树后发现我国新疆河狸和蒙古国河狸位于一个分支,说明两者属于欧亚河狸种下的同一个亚种-蒙新亚种( Castor fiber birulai) 。在16只新疆河狸个体中鉴定出2种单倍型,单倍型多样性( Hd )为0.233 00±0.015 78,核苷酸多样性( Pi )为0.001 23±0.015 90,平均核苷酸差异数( K )为0.700,与其他河狸亚种种群比较后发现新疆河狸遗传多样性较低,基因丰富度低,这与新疆河狸局限的生活环境和人为因素的影响是密切相关的。