Meta-Genomik Gen Analizi için Filtre Tasarımı

Bazi virusler haric tum canlilarda kalitimin temel yapisini nukleik asitler olusturmaktadir. Bilim insanlari kalitim uzerine cesitli calismalar yapmistir. Yapilan arastirmalar ve deneyler sonucunda bilginin depolanmasi, bilgiye ulasma ve bilginin analizinin rahat bir sekilde yapilmasina gerek duyulmustur. Bunun icin biyolojinin bilgisayarlar uzerinde kullanimi 1960’li yillarda baslamistir. Sonrasinda bilgisayar bilimleri gelistikce biyolojinin gelismesi ve arastirma alanlari da artmistir. Gelismeler arttikca biyolojinin buyuk capli deneyler, makro molekul yapilari, DNA ve RNA gibi alanlarda arastirmalari daha cok olmaya baslamistir. Son 50 yil boyunca, hastaliklardaki artis bilim insanlarini DNA dizilimleri uzerinde calisma yapmaya yonlendirmistir. 1970’lerin baslarinda ilk DNA dizileri universite arastirmacilari tarafindan bulunmustur. Daha sonralardan Sanger ve arkadaslari gelistirdikleri dizileme yontemi ile insan genomunu dizilemeyi basarinca Yeni Nesil Dizileme kavrami ortaya cikmistir.  Yeni Nesil Dizileme yontemi kullanilarak cok buyuk boyuttaki gen sekanslarina dizileme yapilmistir. Ancak gen sekanlarinin uzunluklari cok buyuk oldugu icin dizileme yapilirken hatalar ile karsilasilir. Ayrica ideal DNA dizileme daha hizli ve kolay cozume ulasmalidir. Bu calismada gen sekanslamadaki hatalari azaltma uzerinde calisilmistir. Bir filtre yardimi ile buyuk boyuttaki gen sekanlarini benzerlik acisina gore birkac kumeye ayirilmistir. Ayrilan bu dizilerde dogru siralamalar elde edilmeye calisilmistir.