新疆野扁桃 AlsCBF1-A 基因的克隆及生物信息学分析

以野扁桃为实验材料，提取叶片的 RNA ，设计基因特异性引物，利用 RT-PCR 克隆转录因子 CBF 的 cDNA 全长，命名为 AlsCBF1-A ( 登录号 KU975456) ；并对起基因和蛋白进行了生物信息学分析。结果表明，该转录因子基因的 CDS 区长 699bp ，编码 232 个氨基酸，编码蛋白相对分子质量约为 26.0272 kDa ， PI 4.84 ；由无规则卷曲 (C) ， α- 螺旋 (H) ， β- 折叠 (E) 组成，分别占 52.17% ， 21.74% 和 26.09% ；有较强的亲水性，无跨膜区和信号肽存在，有 8 处丝氨酸磷酸化位点、 2 处苏氨酸磷酸化位点、 2 处酪氨酸磷酸化位点；同源性分析表明 AlsCBF1- Ａ基因在高等植物中保守性较高。本研究显示 CBF 转录因子可能与野扁桃的抗寒性相关，此研究为野扁桃抗寒分子机理的进一步研究提供了帮助。