Phylogénie moléculaire et variabilité génétique des échovirus 30 basées sur l’analyse de la région 3’ terminale du gène VP1

Les echovirus 30 representent l’un des serotypes d’enterovirus les plus frequemment isoles, responsables de diverses pathologies dont essentiellement des meningites aseptiques. Plusieurs travaux ont etudie l’epidemiologie moleculaire de ces virus. En analysant une region de 260 nucleotides situee dans la 3’ terminale du gene VP1 (region regroupant la majorite des sequences des echovirus 30), nous nous sommes proposes de realiser un travail de synthese regroupant les principales etudes epidemiologiques sur les echovirus 30. Nous avons etabli un profil phylogenetique de 87 souches d’echovirus 30 geographiquement distinctes et isolees durant un demi-siecle (1957-2003). L’arbre phylogenetique a permis de distinguer 2 genogroupes dont la divergence nucleotidique est superieure a 20 %. Les 2 genogroupes presentent egalement des subdivisions internes appelees genotypes dont la divergence depasse 15 %. Enfin, nous avons note des regroupements phylogenetiques au sein d’un meme genotype. Le profil general de l’arbre phylogenetique est caracterise par une repartition des souches d’echovirus 30 dans le temps independamment de leur emplacement geographique, ce qui temoigne d’une evolution genetique de ces virus dans le temps liee a leur grande plasticite genetique et a leur rapide circulation d’un endroit geographique a un autre.