Ecologie des organismes bactériens symbiotiques

Les iles du Sud-Ouest de l’Ocean Indien constituent l’un des 34 points chauds de biodiversite. Parmi les iles qui composent cette region, Madagascar est listee comme l’un des 5 points chauds leaders dans le monde, distinction qui tient au niveau d’endemisme exceptionnellement eleve que la grande ile abrite en termes d’especes animales et vegetales, et aux risques d'extinction qui pesent sur cette biodiversite unique. Cependant, la diversite microbienne est parfaitement ignoree, pas un mot sur ce monde trop petit sans doute pour qu’on ait pu en apprecier la diversite. Il s’agit aujourd’hui d’une part de decrire cette diversite dont on peut raisonnablement penser qu’elle comporte un certain nombre de taxons endemiques, notamment pour ce qui concerne les microbes symbiotiques et infectieux qui nous interessent. Il s’agit egalement de dechiffrer le role des facteurs biotiques et abiotiques dans la dynamique de ces communautes microbiennes, et au dela, de comprendre l’ecologie de ces micro organismes dans leur environnement. Nous avons aborde ce travail par une exploration non ciblee des micro-organismes infectant les especes animales endemiques et introduites. Nous avons par ailleurs etudie specifiquement les bacteries endo- symbiotiques Wolbachia utilisees dans le developpement d’une strategie de lutte anti vectorielle innovante, et les leptospires, bacteries pathogenes emergentes d’importance medicale dans la region. Nos resultats montrent que la region abrite effectivement des taxons particuliers dont la diversification est etroitement liee a celle des especes animales qu’ils infectent. L’ensemble de ces travaux indique que les approches biogeographiques permettant de comprendre les patrons de distribution des especes animales et vegetales permettent egalement de rendre compte de l’histoire evolutive de micro organismes dont certains a potentiel d’emergence.