芒果八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因的克隆与表达分析

八氢番茄红素脱氢酶 (phytoene desaturase, PDS) 影响类胡萝卜素的合成，是合成途径中关键基因。为了研究芒果果实中 PDS 基因的功能，本试验采用 RACE 方法从‘贵妃’芒果果实中克隆得到了一个八氢番茄红素脱氢酶 ( PDS ) ，该基因全长 cDNA 序列为 1 820 bp ，开放阅读框为 1 650 bp ，编码 549 个氨基酸，分子重量为 61.34 kD ，等电点为 6.78 。聚类分析发现芒果 PDS 蛋白与柚子、香瓜和番木瓜等植物的亲缘关系较近。其氨基酸组成主要是丙氨酸 (ALa) ，白氨酸 (Leu) ，缬氨酸 (Val) 等。利用定量 PCR 技术对不同品种中的 PDS 基因表达量分析，发现红色‘贵妃’品种表达量最高，而绿色‘桂七’品种表达量最低，对其蛋白的结构域、三级结构及互作蛋白进行了预测，发现其含有 Phytoene-desat 、 PLNO2487 superfamily 等结构域。利用 STRING 数据库对其互作蛋白进行分析发现其与 PSY 、 ZDS 、 CRTISO 等蛋白可能有相互作用。本研究为进一步研究芒果果实类胡萝卜素生物合成的分子调控机理提供理论依据。